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. Author manuscript; available in PMC: 2021 Jul 15.
Published in final edited form as: Comput Math Biophys. 2020 Feb 17;8(1):1–35. doi: 10.1515/cmb-2020-0001

Table 11:

Pearson correlation coefficients for cross protein Cα atom blind B-factor prediction obtained by boosted gradient (GBT), convolutional neural network (CNN), and consensus method (CON) for the Superset.

PDB ID N GBT CNN CON PDB ID N GBT CNN CON
1ABA 87 0.73 0.71 0.74 2X5Y 185 0.76 0.68 0.76
1AHO 66 0.66 0.66 0.7 2X9Z 266 0.49 0.52 0.52
1AIE 31 0.75 0.7 0.78 2XHF 310 0.58 0.57 0.58
1AKG 16 0.27 0.32 0.29 2Y0T 111 0.71 0.71 0.74
1ATG 231 0.55 0.51 0.55 2Y72 183 0.65 0.71 0.69
1BGF 124 0.61 0.58 0.62 2Y7L 323 0.66 0.66 0.68
1BX7 51 0.74 0.74 0.76 2Y9F 149 0.74 0.75 0.76
1BYI 238 0.61 0.5 0.6 2YLB 418 0.67 0.66 0.7
1CCR 109 0.55 0.6 0.59 2YNY 326 0.65 0.71 0.69
1CYO 88 0.64 0.7 0.68 2ZCM 348 0.33 0.38 0.36
1DF4 57 0.85 0.85 0.88 2ZU1 360 0.66 0.66 0.68
1E5K 188 0.74 0.72 0.74 3A0M 146 0.53 0.6 0.59
1ES5 260 0.65 0.62 0.66 3A7L 128 0.44 0.61 0.53
1ETL 12 0.37 0.82 0.55 3AMC 614 0.68 0.64 0.69
1ETM 12 0.37 0.63 0.43 3AUB 124 0.5 0.5 0.55
1ETN 12 0.07 0.48 0.13 3B5O 249 0.49 0.55 0.52
1EW4 106 0.59 0.6 0.61 3BA1 312 0.62 0.59 0.63
1F8R 1932 0.52 0.54 0.54 3BED 262 0.45 0.53 0.5
1FF4 65 0.61 0.66 0.64 3BQX 136 0.56 0.55 0.58
1FK5 93 0.59 0.6 0.61 3BZQ 99 0.45 0.53 0.49
1GCO 1044 0.47 0.47 0.5 3BZZ 103 0.38 0.51 0.44
1GK7 39 0.77 0.9 0.82 3DRF 567 0.51 0.45 0.52
1GVD 56 0.71 0.55 0.69 3DWV 359 0.63 0.55 0.63
1GXU 89 0.67 0.68 0.69 3E5T 268 0.44 0.48 0.46
1H6V 2927 0.26 0.34 0.34 3E7R 40 0.72 0.66 0.77
1HJE 13 0.84 0.75 0.9 3EUR 150 0.36 0.42 0.38
1I71 83 0.53 0.58 0.56 3F2Z 148 0.73 0.76 0.75
1IDP 441 0.62 0.6 0.63 3F7E 261 0.65 0.69 0.68
1IFR 113 0.7 0.64 0.7 3FCN 185 0.63 0.65 0.66
1K8U 87 0.57 0.6 0.59 3FE7 89 0.52 0.55 0.54
1KMM 1499 0.64 0.51 0.63 3FKE 250 0.51 0.51 0.54
1KNG 144 0.5 0.52 0.51 3FMY 75 0.65 0.67 0.68
1KR4 107 0.56 0.71 0.63 3FOD 48 0.45 0.57 0.54
1KYC 15 0.62 0.69 0.66 3FSO 238 0.72 0.75 0.74
1LR7 73 0.62 0.61 0.64 3FTD 257 0.64 0.68 0.67
1MF7 194 0.65 0.66 0.67 3G1S 418 0.6 0.57 0.61
1N7E 95 0.63 0.58 0.65 3GBW 170 0.74 0.74 0.75
1NKD 59 0.7 0.7 0.72 3GHJ 129 0.58 0.56 0.59
1NLS 238 0.55 0.57 0.57 3HFO 216 0.51 0.57 0.54
1NNX 93 0.78 0.79 0.8 3HHP 1314 0.61 0.65 0.65
1NOA 113 0.55 0.53 0.56 3HNY 170 0.61 0.6 0.62
1NOT 13 0.69 0.96 0.8 3HP4 201 0.56 0.58 0.58
1O06 22 0.94 0.93 0.95 3HWU 155 0.58 0.65 0.62
1O08 221 0.49 0.47 0.49 3HYD 8 0.99 0.74 0.99
1OPD 85 0.42 0.34 0.41 3HZ8 200 0.45 0.54 0.48
1P9I 29 0.73 0.73 0.74 3I2V 127 0.44 0.52 0.48
1PEF 18 0.79 0.82 0.82 3I2Z 140 0.6 0.6 0.6
1PEN 16 0.36 0.74 0.44 3I4O 154 0.62 0.72 0.66
1PMY 123 0.59 0.7 0.65 3I7M 145 0.44 0.57 0.49
1PZ4 113 0.72 0.8 0.77 3IHS 173 0.61 0.62 0.64
1Q9B 44 0.59 0.85 0.67 3IVV 168 0.83 0.82 0.84
1QAU 112 0.51 0.59 0.57 3K6Y 227 0.56 0.57 0.58
1QKI 3912 0.34 0.45 0.38 3KBE 166 0.56 0.64 0.6
1QTO 122 0.53 0.48 0.54 3KGK 190 0.76 0.8 0.78
1R29 122 0.56 0.59 0.59 3KZD 94 0.55 0.67 0.6
1R7J 90 0.71 0.77 0.75 3L41 219 0.61 0.64 0.64
1RJU 36 0.6 0.46 0.58 3LAA 176 0.35 0.49 0.42
1RRO 108 0.4 0.45 0.43 3LAX 118 0.74 0.69 0.74
1SAU 123 0.54 0.66 0.59 3LG3 846 0.45 0.51 0.5
1TGR 111 0.66 0.69 0.69 3LJI 270 0.57 0.55 0.58
1TZV 157 0.74 0.77 0.76 3M3P 244 0.53 0.59 0.57
1U06 55 0.44 0.4 0.45 3M8J 178 0.72 0.71 0.74
1U7I 259 0.71 0.74 0.74 3M9J 250 0.56 0.52 0.56
1U9C 220 0.57 0.59 0.59 3M9Q 190 0.4 0.48 0.45
1UHA 82 0.71 0.74 0.73 3MAB 180 0.63 0.63 0.65
1UKU 102 0.75 0.76 0.77 3MD4 13 0.88 0.96 0.96
1ULR 87 0.54 0.53 0.56 3MEA 170 0.62 0.63 0.63
1UOY 64 0.72 0.7 0.76 3MGN 277 0.08 0.09 0.09
1USE 47 0.05 0.32 0.12 3MRE 446 0.54 0.54 0.57
1USM 77 0.73 0.72 0.75 3N11 325 0.51 0.47 0.52
1UTG 70 0.62 0.64 0.66 3NE0 208 0.67 0.73 0.71
1V05 96 0.6 0.64 0.63 3NGG 97 0.72 0.75 0.75
1V70 105 0.63 0.62 0.64 3NPV 500 0.51 0.5 0.54
1VRZ 13 0.54 0.34 0.54 3NVG 6 0.51 0.63 0.71
1W2L 97 0.43 0.5 0.47 3NZL 70 0.56 0.58 0.57
1WBE 206 0.6 0.56 0.6 3O0P 197 0.68 0.72 0.71
1WHI 122 0.59 0.56 0.6 3O5P 147 0.6 0.59 0.61
1WLY 322 0.64 0.62 0.66 3OBQ 150 0.59 0.57 0.59
1WPA 107 0.65 0.65 0.67 3OQY 236 0.66 0.59 0.66
1X3O 80 0.41 0.43 0.44 3P6J 145 0.66 0.72 0.69
1XY1 16 0.82 0.75 0.83 3PD7 216 0.68 0.7 0.71
1XY2 8 0.79 0.82 0.81 3PES 166 0.56 0.54 0.57
1Y6X 86 0.5 0.46 0.51 3PID 387 0.48 0.3 0.45
1YJO 6 0.7 −0.06 0.57 3PIW 161 0.72 0.77 0.75
1YZM 46 0.69 0.64 0.7 3PKV 229 0.52 0.51 0.53
1Z21 96 0.68 0.65 0.69 3PSM 94 0.8 0.77 0.82
1ZCE 139 0.7 0.74 0.73 3PTL 289 0.53 0.55 0.55
1ZVA 75 0.7 0.7 0.71 3PVE 363 0.61 0.61 0.63
2A50 469 0.6 0.54 0.6 3PZ9 357 0.61 0.58 0.63
2AGK 233 0.67 0.63 0.67 3PZZ 12 0.94 0.85 0.93
2AH1 939 0.48 0.55 0.54 3Q2X 6 0.95 0.72 0.93
2B0A 191 0.62 0.59 0.63 3Q6L 131 0.47 0.53 0.52
2BCM 415 0.5 0.51 0.52 3QDS 284 0.62 0.62 0.63
2BF9 35 0.48 0.79 0.58 3QPA 212 0.55 0.67 0.59
2BRF 103 0.72 0.77 0.75 3R6D 222 0.65 0.74 0.69
2C71 225 0.57 0.6 0.6 3R87 148 0.47 0.45 0.48
2CE0 109 0.6 0.66 0.64 3RQ9 165 0.46 0.4 0.46
2CG7 110 0.3 0.32 0.32 3RY0 128 0.41 0.49 0.46
2COV 534 0.74 0.72 0.75 3RZY 151 0.65 0.62 0.66
2CWS 235 0.61 0.47 0.6 3S0A 132 0.53 0.49 0.54
2D5W 1214 0.54 0.64 0.59 3SD2 100 0.56 0.56 0.57
2DKO 253 0.78 0.78 0.8 3SEB 238 0.63 0.6 0.63
2DPL 565 0.41 0.36 0.42 3SED 126 0.53 0.52 0.55
2DSX 52 0.34 0.34 0.36 3SO6 157 0.65 0.65 0.66
2OCT 439 0.64 0.67 0.67 3SR3 657 0.5 0.46 0.5
2E3H 81 0.65 0.68 0.67 3SUK 254 0.58 0.59 0.6
2EAQ 89 0.57 0.63 0.61 3SZH 753 0.69 0.67 0.71
2EHP 246 0.66 0.62 0.67 3T0H 209 0.71 0.7 0.73
2EHS 75 0.62 0.67 0.65 3T3K 122 0.76 0.76 0.78
2ERW 53 0.12 0.24 0.16 3T47 145 0.51 0.62 0.57
2ETX 390 0.49 0.48 0.51 3TDN 359 0.47 0.49 0.49
2FB6 129 0.73 0.75 0.75 3TOW 155 0.61 0.63 0.63
2FG1 176 0.57 0.61 0.59 3TUA 226 0.62 0.56 0.63
2FN9 560 0.57 0.54 0.58 3TYS 78 0.66 0.74 0.72
2FQ3 85 0.77 0.82 0.81 3U6G 276 0.53 0.46 0.52
2G69 99 0.62 0.5 0.6 3U97 85 0.67 0.72 0.71
2G7O 68 0.72 0.86 0.8 3UCI 72 0.42 0.42 0.43
2G7S 206 0.55 0.58 0.58 3UR8 637 0.64 0.6 0.64
2GKG 150 0.56 0.64 0.59 3US6 159 0.61 0.63 0.64
2GOM 121 0.69 0.59 0.69 3V1A 59 0.57 0.27 0.55
2GXG 140 0.65 0.67 0.68 3V75 294 0.49 0.56 0.53
2GZQ 203 0.34 0.4 0.37 3VN0 193 0.85 0.85 0.86
2HQK 232 0.77 0.77 0.78 3VOR 219 0.47 0.48 0.48
2HYK 237 0.65 0.63 0.65 3VUB 101 0.59 0.55 0.59
2I24 113 0.44 0.46 0.46 3VVV 112 0.56 0.57 0.57
2I49 399 0.65 0.61 0.66 3VZ9 163 0.72 0.64 0.72
2IBL 108 0.65 0.66 0.67 3W4Q 826 0.65 0.6 0.66
2IGD 61 0.57 0.56 0.58 3ZBD 213 0.55 0.49 0.55
2IMF 203 0.53 0.58 0.56 3ZIT 157 0.52 0.42 0.5
2IP6 87 0.6 0.66 0.63 3ZRX 241 0.54 0.6 0.58
2IVY 89 0.51 0.45 0.51 3ZSL 165 0.49 0.57 0.53
2J32 244 0.75 0.79 0.79 3ZZP 74 0.38 0.48 0.42
2J9W 203 0.64 0.58 0.64 3ZZY 226 0.65 0.65 0.68
2JKU 38 0.57 0.71 0.66 4A02 169 0.59 0.65 0.62
2JLI 112 0.62 0.68 0.65 4ACJ 182 0.62 0.66 0.64
2JLJ 121 0.71 0.71 0.74 4AE7 189 0.65 0.7 0.68
2MCM 112 0.71 0.77 0.75 4AM1 359 0.54 0.52 0.55
2NLS 36 0.23 0.47 0.29 4ANN 210 0.44 0.43 0.45
2NR7 193 0.78 0.76 0.79 4AVR 189 0.56 0.53 0.56
2NUH 104 0.72 0.56 0.7 4AXY 56 0.59 0.65 0.62
2O6X 309 0.76 0.76 0.78 4B6G 559 0.69 0.68 0.71
2OA2 140 0.54 0.55 0.56 4B9G 292 0.74 0.74 0.76
2OHW 257 0.56 0.46 0.54 4DD5 412 0.61 0.62 0.63
2OKT 377 0.42 0.42 0.43 4DKN 423 0.66 0.64 0.68
2OL9 6 0.94 0.85 0.94 4DND 93 0.62 0.67 0.65
2PKT 93 0.01 −0.04 −0.01 4DPZ 113 0.7 0.74 0.72
2PLT 98 0.52 0.53 0.54 4DQ7 338 0.55 0.6 0.57
2PMR 83 0.6 0.63 0.63 4DT4 170 0.67 0.69 0.69
2POF 428 0.62 0.6 0.66 4EK3 313 0.6 0.58 0.61
2PPN 122 0.64 0.54 0.63 4ERY 318 0.57 0.59 0.59
2PSF 608 0.42 0.42 0.43 4ES1 96 0.69 0.69 0.71
2PTH 193 0.69 0.7 0.71 4EUG 225 0.56 0.55 0.58
2Q4N 1208 0.44 0.43 0.45 4F01 459 0.35 0.26 0.33
2Q52 3296 0.55 0.28 0.52 4F3J 143 0.58 0.63 0.62
2QJL 107 0.54 0.57 0.56 4FR9 145 0.6 0.56 0.61
2R16 185 0.44 0.49 0.46 4G14 5 −0.28 0.45 0.04
2R6Q 149 0.63 0.62 0.65 4G2E 155 0.75 0.72 0.76
2RB8 93 0.67 0.7 0.7 4G5X 584 0.71 0.73 0.74
2RE2 249 0.65 0.66 0.68 4G6C 676 0.56 0.54 0.58
2RFR 166 0.61 0.69 0.66 4G7X 216 0.45 0.4 0.45
2V9V 149 0.53 0.52 0.54 4GA2 183 0.61 0.53 0.61
2VE8 515 0.55 0.55 0.58 4GMQ 94 0.76 0.67 0.76
2VH7 94 0.75 0.56 0.73 4GS3 90 0.61 0.56 0.61
2VIM 114 0.44 0.47 0.47 4H4J 278 0.75 0.74 0.77
2VPA 217 0.66 0.75 0.71 4H89 175 0.53 0.58 0.56
2VQ4 106 0.7 0.75 0.72 4HDE 167 0.66 0.72 0.7
2VY8 162 0.77 0.68 0.76 4HJP 308 0.68 0.6 0.67
2VYO 207 0.6 0.63 0.63 4HWM 129 0.54 0.6 0.57
2W1V 551 0.64 0.69 0.66 4IL7 99 0.55 0.55 0.56
2W2A 350 0.59 0.6 0.61 4J11 377 0.58 0.49 0.58
2W6A 139 0.71 0.69 0.72 4J5O 268 0.67 0.68 0.69
2WJ5 110 0.45 0.53 0.48 4J5Q 162 0.72 0.74 0.74
2WUJ 103 0.35 0.54 0.45 4J78 305 0.63 0.6 0.64
2WW7 161 0.36 0.35 0.37 4JG2 202 0.72 0.72 0.73
2WWE 120 0.49 0.55 0.53 4JVU 207 0.7 0.7 0.72
2X1Q 240 0.44 0.5 0.47 4JYP 550 0.59 0.67 0.65
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6RXN 45 0.59 0.6 0.61