Table 2. SNV information for each analyzed macaque.

Sample	Filtered				Downsampled (~15×)
	SNVs	Homo	Het		Callable sites	Het	Heterozygosity	Ts	Tv	Ts/Tv
For individual macaque genome samples, short ID, total number of single nucleotide variants (SNVs), number of heterozygous SNVs (Het), number of homozygous SNVs (Homo), and transitions/transversions (Ts/Tv) are shown.
Marc_R02	7 271 275	5 383 371	1 887 904		2 555 381 332	3 782 713	0.001 480	10 682 013	4 949 053	2.16
Marc_R19	7 000 609	5 675 953	1 324 656		2 553 354 858	2 644 171	0.001 036	10 334 343	4 762 614	2.17
Mass	7 926 468	4 560 039	3 366 429		2 519 264 130	6 121 131	0.002 430	10 831 112	5 023 843	2.16
Mfas_1	6 909 052	3 101 413	3 807 639		2 562 592 812	7 612 441	0.002 971	10 058 278	4 638 571	2.17
Mfas_Mau	6 773 377	3 895 560	2 877 817		2 549 849 925	5 881 316	0.002 307	10 190 936	4 659 300	2.19
Mfus	4 805 372	3 403 338	1 402 034		2 562 072 275	2 619 778	0.001 023	7 074 787	3 279 216	2.16
Mmul_Chi	5 192 005	2 071 981	3 120 024		2 556 851 619	5 748 608	0.002 248	7 168 259	3 273 752	2.19
Mmul_Ind	4 058 527	1 370 638	2 687 889		2 550 406 218	5 072 952	0.001 989	5 723 495	2 602 782	2.20
Mnem_1	8 733 029	4 860 252	3 872 777		2 559 986 484	7 267 811	0.002 839	12 211 436	5 571 807	2.19
Mnem_2	8 568 074	4 907 725	3 660 349		2 557 580 297	7 210 573	0.002 819	12 310 845	5 636 798	2.18
Mnig	7 743 384	6 043 224	1 700 160		2 553 652 584	3 353 047	0.001 313	11 259 320	5 250 264	2.14
Mthi_HT1	6 133 336	5 691 120	442 216		2 488 747 849	903 396	0.000 363	9 401 283	4 277 321	2.20
Mthi_R25	6 858 249	5 921 203	937 046		2 552 204 059	1 886 287	0.000 739	10 137 409	4 730 651	2.14
Mton	8 229 873	5 597 616	2 632 257		2 555 184 660	5 168 771	0.002 023	11 872 755	5 501 580	2.16
Panu	17 507 271	15 461 142	2 046 129		2 529 072 236	3 620 049	0.001 431	25 935 871	11 112 178	2.33