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. 2021 Aug 4;28:18. doi: 10.1186/s40709-021-00149-2

Table 12.

Comparison of drug binding motifs of analyzed NSPs for antiviral drugs

7K3N (Nsp1) 6WEY (Nsp3) 6M03 (Nsp5) 7JLTNsp7-8 6W4B
(Nsp9)
6ZCTNsp10 6M71 (Nsp7/8/12) 7NIO Nsp13 5C8S (Nsp14) 6VWW (Nsp15) 7BQ7 Nsp16-10 Total binding sites
Amphetamine  +  1
Amprenavir  +  +  +   +  +  +  +   +  +   +  +  +   +  +  +   +  +  +   +  +   +  +  22
Atazanavir  +   +  +   +   +   +   +   +  +  +  10
Darunavir

 +  +  +  +  + 

 +  +  +  +  + 

 +  +  +  +  +  +   +  +   +   +  +  +   +  +  +  +   +  +   +  +  +  +  +  +  +   +  +  +  +  +   +  +  +  +  +  45
Grazoprevir  +   +  +   +   +  +  6
Indinavir  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +  +   +  12
Lopinavir  +   +  +   +  +   +  +  +   +  9
Nelfinavir  +  +   +   +   +  +   +   +  8
Nevirapine  +  1
Ribavirin  +   +  2
Rimantadine  +   +  +   +  +  +   +   +  +  +   +   +  +   +  +  +  +  +   +  +  20
Ritonavir  +   +   +   +  +  5
Saquinavir  +  +   +   +   +   +  +  +   +   +  +   +  +  +   +  +  +  +  18
Tipranavir  +   +  +   +   +   +  +   +   +  +   +   +  12

Among fourteen drugs four (Amprenavir, Darunavir, Rimantadine, Saquinavir) have very significant and the other two (Indinavir, Tipranavir) have moderatenumber of binding motifs. ‘ + ’ sign indicates no. of drug binding motifs