Skip to main content
. 2021 Aug 11;9:e11846. doi: 10.7717/peerj.11846

Table 3. Breed wise details of estimated Genetic Diversity Indices for each microsatellite markers.

Locus Expected Heterozygosity (He) Theta H (θH) Number of alleles (Na) F ST p-Value of FST estimation
Nilli-Ravi Murrah Gojri Nilli-Ravi Murrah Gojri Nilli-Ravi Murrah Gojri
BM1818 0.69 0.68 0.71 2.29 2.17 2.49 7 9 6 0.029 0.078
CSSM19 0.74 0 0.73 2.80 0 2.75 6 0 6 NE NE
CSSM33 0.71 0.73 0.63 2.49 2.67 1.74 8 9 7 0.194 0.00001
CSSM45 0.65 0.80 0.73 1.87 3.98 2.72 5 6 6 0.204 0.00001
CSSM47 0.81 0.69 0.82 4.23 2.25 4.63 10 10 11 0.175 0.00001
CSSM66 0.79 0.61 0.82 3.67 1.60 4.43 7 6 9 0.176 0.00001
Hel013 0.67 0.75 0.82 2.08 3 4.49 8 8 9 0.139 0.00001
ILSTS19 0.14 0.17 0.12 0.16 0.20 0.14 2 6 3 0.809 0.00001
ILSTS25 0.58 0.61 0.72 1.39 1.59 2.52 5 6 8 0.179 0.00001
ILSTS26 0.67 0.61 0.76 2.05 1.57 3.26 6 6 5 0.084 0.00001
ILSTS28 0.76 0.76 0.76 3.25 3.16 3.21 8 7 6 0.002 0.7165
ILSTS29 0.33 0.26 0.82 0.49 0.35 4.49 6 4 10 0.376 0.00001
ILSTS30 0.71 0.60 0.69 2.45 1.47 2.25 7 6 6 0.194 0.00001
ILSTS33 0.66 0.68 0.59 1.99 2.14 1.47 6 7 3 0.005 0.51026
ILSTS36 0.66 0.67 0.72 1.98 2.03 2.58 6 6 12 0.160 0.00001
ILSTS52 0.67 0 0.73 2.00 0 2.72 9 0 8 NE NE
ILSTS56 0.40 0.53 0.59 0.67 1.12 1.45 5 7 8 0.345 0.00001
ILSTS58 0.81 0.85 0.77 4.24 5.70 3.40 7 9 11 0.088 0.00001
ILSTS60 0.45 0.36 0.60 0.81 0.57 1.53 4 3 14 0.016 0.18573
ILSTS61 0.66 0.81 0.76 1.91 4.23 3.23 6 13 11 0.178 0.00001
ILSTS089 0 0.79 0.76 0 3.76 3.14 0 6 6 NE NE
ILSTS95 0.80 0.71 0.71 4.08 2.43 2.48 10 11 8 0.061 0.00001
Mean 0.61 0.58 0.70 1.55 1.36 2.33 6.27 6.59 7.86 0.18
SD 0.22 0.25 0.15 2.33 3.10 2.83

Note:

NE, not estimable in the global analysis of molecular variance.