TABLE 3.

PANGO lineage distribution of screen-detected variants by RT-qPCR

PANGO lineage	RT-qPCR phenotypea
	L452R E484 N501	L452 E484K N501	L452 E484 N501Y	L452 E484K N501Y	L452 E484 N501
B.1	2 (3)	2 (14)	1 (5)	0 (0)	14 (12)
B.1.1	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2 (2)
B.1.1.174	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)
B.1.1.222	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)
B.1.1.228	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)
P.2b	0 (0)	11 (79)	0 (0)	0 (0)	0 (0)
B.1.1.291	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)
B.1.1.368	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2 (2)
B.1.1.416	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	3 (3)
B.1.1.432	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)
B.1.1.517	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)
B.1.1.519	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	8 (7)
B.1.1.7c	0 (0)	0 (0)	17 (77)	0 (0)	0 (0)
B.1.139	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2 (2)
B.1.2	0 (0)	0 (0)	3 (14)	0 (0)	41 (34)
B.1.232	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	5 (4)
B.1.234	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	3 (3)
B.1.239	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)
B.1.240	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	3 (3)
B.1.243	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	6 (5)
B.1.265	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)
B.1.311	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	6 (5)
B.1.323	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)
B.1.351c	0 (0)	0 (0)	0 (0)	3 (100)	0 (0)
B.1.361	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)
B.1.369	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2 (2)
B.1.375	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2 (2)
B.1.427c	44 (63)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)
B.1.429c	24 (34)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)
B.1.453	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)
B.1.480	0 (0)	0 (0)	1 (5)	0 (0)	0 (0)
B.1.526b	0 (0)	1 (7)	0 (0)	0 (0)	0 (0)
B.1.561	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	4 (3)
B.1.565	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)
B.1.568	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)
B.1.577	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)
B.1.596	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	2 (2)
B.1.599	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	1 (1)
Total	70	14	22	3	120

^aData are presented as number (column percent).

^bCDC-classified variant of interest as of 6 May 2021.

^cCDC-classified variant of concern as of 6 May 2021.