Table 8.
Interactions from docking: Hydrogen bonds (a) and salt bridges (b) between α7 nAChR –Spike interactions.
| α7 nAChR | DISTANCE (Ao) | SPIKE |
|---|---|---|
| A:Arg 182 [NH1] | 3.22 | B:Tyr 380 [O] |
| A:Arg 182 [NH1] | 2.79 | B:Gly 381 [O] |
| A:Lys 139 [NZ] | 2.74 | B:Thr 385 [O] |
| A:Lys 139 [NZ] | 2.74 | B:Lys 386 [O] |
| A:Ser 124 [OG] | 2.74 | B:Asn 388 [O] |
| A:Trp 145 [NE1] | 3.82 | B:Thr 393 [OG1] |
| A:Arg 182 [NH2] | 2.70 | B:Thr 430 [OG1] |
| A:Trp 145 [NE1] | 3.02 | B:Ala 520 [O] |
| A:Ser 124 [OG] | 3.60 | B:Gly 526 [O] |
| A:Tyr 91 [O] | 3.02 | B:Cys 391 [N] |
| A:Asp 126 [OD1] | 2.64 | B:Lys 386 [NZ] |
| A:Glu 185 [OE1] | 2.65 | B:Arg 355[NH1] |
| A:Tyr 191 [OH] |
3.33 |
B:His 519 [NE2] |
| α7 nAChR |
DISTANCE (Ao) |
SPIKE |
| A:Asp 182 [NH1] | 2.64 | B:Lys 386 [NZ] |
| A:Glu 185[OE1] | 3.60 | B:Arg 35[NH2] |
| A:Glu 185[OE1] | 2.65 | B:Arg 35[NH1] |
| A:Glu 185[OE2] | 3.36 | B:Arg 35[NH1] |