Table 2.
Comparison of goal-directed benchmarks.
| Benchmark | Best of dataset | SMILES LSTM | SMILES GA | Graph GA | Graph MCTS | cRNN | EDM (ours) | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Celecoxib red | 0.505 | 1.000 | 0.607 | 1.000 | 0.378 | 1.000 | 1.000 | ||||||
| Troglitazone red | 0.419 | 1.000 | 0.558 | 1.000 | 0.312 | 1.000 | 1.000 | ||||||
| Thiothixene red | 0.456 | 1.000 | 0.495 | 1.000 | 0.308 | 1.000 | 1.000 | ||||||
| LogP(− 1.0) | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.980 | 1.000 | 1.000 | ||||||
| LogP(8.0) | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.979 | 1.000 | 1.000 | ||||||
| TPSA(150.0) | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | ||||||
| CNS MPO | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | ||||||
| QED | 0.948 | 0.948 | 0.948 | 0.948 | 0.944 | 0.948 | 0.948 | ||||||