Table 1.
Strains used in this study and specificity tests with mutL-targeting PCR assays.
| No. | Species | Strain No. | Other Destination | Species-Specific PCR Assays | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| spLplan-F/R | spLarg-F/R | spLpara-F/R | spLpen-F/R | ||||
| 1 | L. plantarum | BCRC10069T | ATCC 14917T | + | − | − | − |
| 2 | BCRC 10357 | ATCC 8014 | + | − | − | − | |
| 3 | BCRC 12251 | ATCC 10241 | + | − | − | − | |
| 4 | BCRC 14059 | ATCC 10012 | + | − | − | − | |
| 5 | BCRC 15478 | NCDO 1193 | + | − | − | − | |
| 6 | BCRC 18858 | NRIC 1943 | + | − | − | − | |
| 7 | BCRC 80061 | − | + | − | − | − | |
| 8 | BCRC 80222 | CECT 5787 | + | − | − | − | |
| 9 | BCRC 80578 | NCDO 772 | + | − | − | − | |
| 10 | BCRC 80580 | CICC 6026 | + | − | − | − | |
| 11 | BCRC 80581 | CICC 20764 | + | − | − | − | |
| 12 | BCRC 06B0002 | − | + | − | − | − | |
| 13 | BCRC 06B0006 | − | + | − | − | − | |
| 14 | BCRC 06B0023 | − | + | − | − | − | |
| 15 | BCRC 06B0036 | − | + | − | − | − | |
| 16 | BCRC 11B0079 | − | + | − | − | − | |
| 17 | BCRC 11B0117 | − | + | − | − | − | |
| 18 | BCRC 11B0122 | − | + | − | − | − | |
| 19 | BCRC 11B0168 | − | + | − | − | − | |
| 20 | BCRC 11B0177 | − | + | − | − | − | |
| 21 | L. argentoratensis | BCRC17638T | DSM 16365T | − | + | − | − |
| 22 | BCRC 17639 | CCUG 50788 | − | + | − | − | |
| 23 | BCRC 17640 | CCUG 50789 | − | + | − | − | |
| 24 | L. paraplantarum | BCRC 17178T | DSM 10667T | − | − | + | − |
| 25 | BCRC 17970 | ATCC 10776 | − | − | + | − | |
| 26 | BCRC 17971 | ATCC 700210 | − | − | + | − | |
| 27 | BCRC 80221 | CECT 5783 | − | − | + | − | |
| 28 | L. pentosus | BCRC 11053T | ATCC 8041T | − | − | − | + |
| 29 | BCRC 17972 | LMG 9210 | − | − | − | + | |
| 30 | BCRC 80017 | JCM 8334 | − | − | − | + | |
| 31 | BCRC 80018 | JCM 8335 | − | − | − | + | |
| 32 | BCRC 06B0048 | − | − | − | − | + | |
| 33 | L. daoliensis | 116-1AT | NCIMB 15181 | − | − | − | − |
| 34 | L. pingfangensis | 382-1T | NCIMB 15187 | − | − | − | − |
| 35 | L. daowaiensis | 203-3T | NCIMB 15183 | − | − | − | − |
| 36 | L. nangangensis | 381-7T | NCIMB 15186 | − | − | − | − |
| 37 | L. herbarum | BCRC 80996T | DSM 100358T | − | − | − | − |
| 38 | L. fabifermentans | BCRC 18841T | LMG 24284T | − | − | − | − |
| 39 | L. plajomi | BCRC 80928T | NBRC 107233T | − | − | − | − |
| 40 | L. xiangfangensis | BCRC 80512T | LMG 26013T | − | − | − | − |
| 41 | L. modestisalitolerans | BCRC 80927T | NBRC 107235T | − | − | − | − |
| 42 | L. dongliensis | 218-3T | NCIMB 15184T | − | − | − | − |
| 43 | L. songbeiensis | 398-2T | NCIMB 15189T | − | − | − | − |
| 44 | L. mudanjiangensis | 11050T | LMG 27194T | − | − | − | − |
| 45 | L. acidophilus | BCRC 10695T | ATCC 4356T | − | − | − | − |
| 46 | L. casei | BCRC 10697T | ATCC 393T | − | − | − | − |
| 47 | L. crispatus | BCRC 14618T | ATCC 33820T | − | − | − | − |
| 48 | L. curvatus | BCRC 12189T | DSM 20019T | − | − | − | − |
| 49 | L. delbrueckii subsp. bulgaricus | BCRC 10696T | ATCC 11842T | − | − | − | − |
| 50 | L. gallinarum | BCRC 17266T | ATCC 33199T | − | − | − | − |
| 51 | L. gasseri | BCRC 14619T | ATCC 33323T | − | − | − | − |
| 52 | L. paracasei | BCRC 12248T | ATCC 25302T | − | − | − | − |
| 53 | L. rhamnosus | BCRC 10940T | ATCC 7469T | − | − | − | − |
| 54 | L. sakei | BCRC 14622T | ATCC 15521T | − | − | − | − |
| 55 | L. taiwanensis | BCRC 17755T | JCM 18086T | − | − | − | − |
| 56 | L. ultunensis | BCRC 17714T | DSM 16047T | − | − | − | − |
BCRC, Bioresource Collection and Research Center at Food Industry Research and Development Institute, Taiwan; +, PCR products with specific primer detected; −, PCR products with specific primer not detected.