. 2021 Sep 16;12(1):73–89. doi: 10.1016/j.jtcme.2021.09.002

Table 2.

The residues that interact with the 6 potential natural products within the ACE2-free spike and spike-ACE2 complex proteins.

Compound	ACE2-free spike protein		Spike-ACE2 complex protein
Compound	Electrostatic interactions (Å)	Hydrophobic interactions (Å)	Electrostatic interactions (Å)	Hydrophobic interactions (Å)
Dioscin	Tyr351 (2.25 Å), Asn354 (2.45 Å)	Phe486 (5.05 Å), Arg346 (4.18 Å), Ala348 (3.46 Å), Ala352 (3.77 Å), Leu452 (4.34 Å, 5.36 Å), Leu492 (5.47 Å, 5.00 Å), Pro463 (3.91 Å, 5.23 Å)	Asp30 (2.51 Å), Lys417 (2.45 Å), Asp420 (2.59 Å), Asn460 (2.87 Å), Tyr421 (2.40 Å), Lys458 (2.35 Å)	His34 (5.02 Å, 5.47 Å), Tyr473 (5.41 Å), Lys417 (3.96 Å, 4.72 Å), Lys26 (4.45 Å)
Celastrol	Phe490 (2.05 Å, 2.48 Å), Glu465 (3.75 Å),	Ile468 (5.32 Å), Phe486 (5.41 Å), Leu492 (5.31 Å), Leu452 (3.95 Å, 4.67 Å, 4.69 Å), Lys462 (4.79 Å), Pro463 (3.51 Å), Leu492 (4.11 Å, 4.75 Å)	Arg393 (2.14 Å), Ala386 (2.56 Å)	Pro389 (4.66 Å), His34 (5.38 Å), Pro389 (4.79 Å, 5.10 Å, 5.27 Å), Leu29 (4.67 Å), Lys26 (4.73 Å)
Saikosaponin C	Glu471 (2.35 Å), Asn354 (2.83 Å), Asn450 (2.98 Å, 2.69 Å)	Phe486 (4.25 Å, 5.30 Å, 5.34 Å), Ile468 (4.20 Å, 5.25 Å), Leu492 (4.14 Å, 4.62 Å, 4.87 Å, 5.35 Å), Leu452 (3.96 Å, 4.68 Å, 4.85 Å, 5.48 Å)	Asp30 (2.61 Å), Asn460 (2.50 Å)	His34 (5.01 Å), Lys417 (4.34 Å)
Epimedin C	Ser349 (2.08 Å), Phe490 (2.16 Å), Leu492 (1.88 Å)	Leu492 (4.96 Å), Phe486 (4.92 Å), Lys462 (4.79 Å), Pro463 (4.62 Å), Leu452 (3.78 Å, 3.96 Å, 3.99 Å)	Lys26 (2.56 Å), Thr27 (1.89 Å), Asn33 (2.16 Å), Gln96 (2.49 Å), Tyr473 (2.36 Å), Asp30 (4.82 Å, 4.86 Å)	His34 (4.57 Å), Lys417 (5.19 Å), Tyr421 (5.24 Å)
Torvoside K	Ser349 (2.04 Å), Pro463 (3.02 Å), Leu492 (2.38 Å)	Tyr449 (4.77 Å, 5.44 Å), Leu452 (4.08 Å, 4.83 Å, 5.37 Å), Pro463 (3.94 Å), Ala352 (3.92 Å)	Arg403 (2.49 Å)	Phe456 (4.93 Å), Lys417 (4.09 Å)
Amentoflavone	Glu465 (4.44 Å), Phe490 (2.5 Å)	Leu452 (4.21 Å), Leu492 (4.39 Å, 4.6 Å), Ile468 (5.23 Å), Phe486 (4.81 Å)	Lys26 (2.56 Å), Glu37 (2.22 Å), Ala386 (2.25 Å), Arg393 (2.09 Å), Arg403 (2.23 Å), Tyr505 (2.51 Å)	Pro389 (4.47 Å), Lys417(5.04 Å), Tyr505 (5.94 Å)