. 2021 Sep 1;13(17):21294–21308. doi: 10.18632/aging.203459

Table 3. Correlation analysis between PPM1D and related genes and markers of immune cells in TIMER.

Description	Gene markers	HCC				CHOL
		None		Purity		None		Purity
		Core	P	Core	P	Core	P	Core	P
CD8+ T cell	CD8A	0.17	^**	0.254	^***	1.107	0.533	0.019	0.914
	CD8B	0.07	0.18	0.15	^**	0.073	0.673	0.003	0.987
T cell (general)	CD3D	0.03	0.59	0.1	0.06	0.232	0.173	0.152	0.385
	CD3E	0.1	0.06	0.206	^***	0.172	0.315	0.066	0.705
	CD2	0.08	0.12	0.182	^***	0.151	0.377	0.046	0.791
B cell	CD19	0.18	^***	0.222	^***	0.307	0.068	0.243	0.160
	CD79A	0.14	^**	0.238	^***	0.287	0.090	0.221	0.203
Monocyte	CD86	0.27	^***	0.392	^***	0.127	0.460	0.023	0.897
	CSF1R	0.21	^***	0.326	^***	0.172	0.315	0.100	0.568
TAM	CCL2	0.19	^***	0.295	^***	0.281	0.096	0.246	0.155
	CD68	0.18	^***	0.255	^***	0.181	0.289	0.132	0.449
	IL10	0.23	^***	0.324	^***	0.251	0.140	0.158	0.364
Ml Macro-phage	NOS2	0.21	^***	0.223	^***	0.307	0.069	0.312	0.068
	IRF5	0.39	^***	0.381	^***	0.219	0.199	0.179	0.304
	PTGS2	0.28	^***	0.404	^***	0.383	0.021	0.338	0.046
M2 Macro-phage	CD163	0.28	^***	0.393	^***	0.392	0.018	0.343	0.044
	VSIG4	0.18	^***	0.285	^***	0.28	0.099	0.216	0.213
	MS4A4A	0.22	^***	0.33	^***	0.286	0.091	0.21	0.227
Natural killer cell	KIR2DL1	0.06	0.23	0.058	0.28	-0.202	0.237	–0.239	0.166
	KIR2DL3	0.18	^***	0.217	^***	-0.015	0.929	–0.04	0.818
	KIR2DL4	0.12	0.02	0.152	^**	-0.214	0.211	–0.272	0.114
	KIR3DL1	0.13	0.01	0.157	^**	-0.124	0.471	–0.158	0.364
	KIR3DL2	0.08	0.12	0.130	0.02	-0.105	0.542	–0.113	0.516
	KIR3DL3	0.04	0.5	0.017	0.75	-0.191	0.265	–0.225	0.193
	KIR2DS4	0.09	0.08	0.099	0.07	-0.114	0.507	–0.149	0.392
Dendritic cell	HLA-DPB1	0.16	^**	0.253	^***	0.088	0.608	–0.004	0.982
	HLA-DQB1	0.07	0.21	0.147	^**	0.311	0.066	0.269	0.118
	HLA-DRA	0.22	^***	0.321	^***	0.071	0.681	–0.033	0.850
	HLA-DPA1	0.22	^***	0.322	^***	0.056	0.743	–0.048	0.783
	BDCA-1	0.19	^***	0.263	^***	0.136	0.428	0.052	0.767
	BDCA-4	0.51	^***	0.541	^***	0.515	^**	0.484	^**
	CD11c	0.27	^***	0.356	^***	0.288	0.089	0.219	0.206
Th1	TBX21	0.10	0.05	0.176	^**	0.147	0.390	0.033	0.852
	STAT4	0.18	^***	0.232	^***	0.099	0.564	0.04	0.820
	STAT1	0.41	^***	0.446	^***	0.4	^*	0.379	^*
	TNF	0.12	0.02	0.187	^***	0.037	0.83	–0.067	0.703
	INF-α	0.22	^***	0.309	^***	0.319	0.059	0.294	0.087
Th2	GATA3	0.16	^**	0.280	^***	0.046	0.79	–0.082	0.638
	STAT6	0.39	^***	0.366	^***	0.529	^**	0.548	^***
	STAT5A	0.35	^***	0.404	^***	0.228	0.181	0.196	0.258
	IL13	0.09	0.08	0.097	0.07	0.04	0.818	–0.011	0.95
Tfh	BCL6	0.41	^***	0.401	^***	0.407	^*	0.4	^*
	IL21	0.12	0.02	0.162	^**	0.326	0.053	0.286	0.095
Th17	STAT3	0.49	^***	0.528	^***	0.547	^***	0.557	^***
	IL17A	0.1	0.06	0.107	0.05	0.053	0.759	0.005	0.979
Treg	FOXP3	0.3	^***	0.335	^***	0.264	0.12	0.189	0.277
	CCR8	0.43	^***	0.513	^***	0.344	^*	0.293	0.088
	STAT5B	0.74	^***	0.731	^***	0.642	^***	0.637	^***
	TGFB1	0.21	^***	0.297	^***	0.307	0.069	0.265	0.124
T cell exhaustion	PD-1	0.14	^**	0.198	^***	0.203	0.234	0.157	0.369
	CTLA4	0.11	0.03	0.186	^***	0.225	0.186	0.171	0.325
	LAG3	0.11	0.04	0.149	^**	0.08	0.64	0.005	0.977
	TIM-3	0.23	^***	0.351	^***	0.126	0.464	0.036	0.839
	GZMB	0.04	0.43	0.075	0.17	0.039	0.823	–0.058	0.742