TABLE 2.

The Ka and Ks values for homologous gene pairs in cotton.

Paralogous	Ka	Ks	Ka/Ks
GhEXO3_At/GhEXO17_At	0.354	1.735	0.204
GhEXO1_At/GhEXO6_Dt	0.757	4.174	0.181
GhEXO3_At/GhEXO17_Dt	0.368	1.521	0.242
GhEXO1_At/GhEXO1_Dt	0.004	0.039	0.108
GhEXO2_At/GhEXO2_Dt	0.022	0.037	0.586
GhEXO3_At/GhEXO3_Dt	0.024	0.062	0.388
GhEXO4_At/GhEXO4_Dt	0.024	0.056	0.424
GhEXO5_At/GhEXO5_Dt	0.004	0.043	0.090
GhEXO6_At/GhEXO6_Dt	0.009	0.057	0.158
GhEXO7_At/GhEXO7_Dt	0.009	0.049	0.184
GhEXO8_At/GhEXO8_Dt	0.007	0.025	0.269
GhEXO9_At/GhEXO9_Dt	0.020	0.046	0.441
GhEXO10_At/GhEXO10_Dt	0.014	0.021	0.664
GhEXO11_At/GhEXO11_Dt	0.006	0.044	0.127
GhEXO12_At/GhEXO12_Dt	0.010	0.051	0.205
GhEXO13_At/GhEXO13_Dt	0.008	0.017	0.472
GhEXO14_At/GhEXO14_Dt	0.012	0.033	0.364
GhEXO15_At/GhEXO15_Dt	0.013	0.025	0.506
GhEXO16_At/GhEXO16_Dt	0.017	0.148	0.117
GhEXO17_At/GhEXO17_Dt	0.034	0.137	0.249
GhEXO18_At/GhEXO18_Dt	0.009	0.055	0.167
GhEXO19_At/GhEXO19_Dt	0.015	0.071	0.214

Ka: non-synonymous, Ks: synonymous.