Table 2.

SNP distribution along tomato chromosomes in JAGF4 and JAGF5 populations

Chromosome	Length (bp)	SNP number JAGF4	SNP number JAGF5	% SNP JAGF4	% SNP JAGF5	H JAGF4	PIC JAGF4	H JAGF5	PIC JAGF5
Chr0	20852292	47913	47753	35.42	27.04	0.316	0.249	0.292	0.229
Chr1	98455869	5794	7238	4.28	4.1	0.252	0.199	0.21	0.166
Chr2	5597758	4119	4922	3.04	2.79	0.264	0.206	0.223	0.174
Chr3	72290146	4596	5882	3.4	3.33	0.269	0.211	0.202	0.158
Chr4	66557038	9892	12359	7.31	7	0.396	0.302	0.361	0.276
Chr5	66723567	13763	17481	10.18	9.9	0.410	0.313	0.369	0.28
Chr6	49794276	22500	27373	16.64	15.5	0.343	0.269	0.332	0.258
Chr7	68175699	2692	5142	2	2.91	0.188	0.149	0.113	0.09
Chr8	65987440	3676	4533	2.72	2.57	0.236	0.186	0.214	0.168
Chr9	72906345	2519	19947	1.86	11.29	0.171	0.136	0.028	0.022
Chr10	65633393	2776	3956	2.05	2.24	0.193	0.153	0.158	0.126
Chr11	56597135	10946	13278	8.09	7.52	0.339	0.262	0.305	0.238
Chr12	68126176	4069	6732	3.01	3.81	0.257	0.200	0.15	0.117

The chromosome length, the percentage of SNP per chromosome, the heterozygous values (H) and the polymorphism information content (PIC) are also reported