Table 1.
Primer Sequences used for qRT-PCR.
| Genes | Forward primer | Reverse primer |
|---|---|---|
| Human | ||
| METTL3 | 5′-CAAGCTGCACTTCAGACGAA-3′ | 5′-GCTTGGCGTGTGGTCTTT-3′ |
| METTL14 | 5′-AGAAACTTGCAGGGCTTCCT-3′ | 5′-TCTTCTTCATATGGCAAATTTTCTT-3′ |
| METTL4 | 5′-TATCCCTCTTGGTCTGTGGAG-3′ | 5′-ACCTTCGTAGGGCTTTTTGTG-3′ |
| WTAP | 5′-GGCGAAGTGTCGAATGCT-3′ | 5′-CCAACTGCTGGCGTGTCT-3′ |
| ALKBH5 | 5′-CGGCGAAGGCTACACTTACG-3′ | 5′-CCACCAGCTTTTGGATCACCA-3′ |
| FTO | 5′-ACTTGGCTCCCTTATCTGACC-3′ | 5′-TGTGCAGTGTGAGAAAGGCTT-3′ |
| YTHDF1 | 5′-CAAGCACACAACCTCCATCTTCG-3′ | 5′-GTAAGAAACTGGTTCGCCCTCAT-3′ |
| YTHDC1 | 5′-AGATGGGTCTGTCAGATCTGGT-3′ | 5′-TCTGAACCTGCATATGACTCTGAT-3′ |
| ATG3 | 5′-CAGGCATGCTGAGGTGATGA-3′ | 5′-CGTTAACAGCCATTTTGCCACT-3′ |
| ATG4A | 5′-AAACCCCTGCTGCTCATTGT-3′ | 5′-ATGCCCCTAAAGACTGTGGC-3′ |
| ATG5 | 5′-AAGACCTTCTGCACTGTCCATC-3′ | 5′-TGCAATCCCATCCAGAGTTGC-3′ |
| ATG7 | 5′-TTGAGCGGCGGATCCAATTC-3′ | 5′-ATCTGGTGTCCATCAGCTTCAG-3′ |
| BECN1 | 5′-AGGTACCGACTTGTTCCCTA-3′ | 5′-TCCATCCTGTACGGAAGACA-3′ |
| ATG9A | 5′-AGGGCTGGAGAGGAGCACATAC-3′ | 5′-GGCGACGTGCACCAACAG-3′ |
| ATG12 | 5′-TGGAGGGGAAGGACTTACGG-3′ | 5′-TGGATGGTTCGTGTTCGCTC-3′ |
| ATG14 | 5′-CTGTACGTGGCTGTGGAGC-3′ | 5′-TCTTGCTTGCTCTTAAGTCGGC-3′ |
| ATG16 | 5′-CATCTCGGAGCAACTGAGGC-3′ | 5′-CCAGTTGAGCTAACTCCCCAC-3′ |
| GAPDH | 5′-AAATCCCATCACCATCTTCCAG-3′ | 5′-AGGGGCCATCCACAGTCTTCT-3′ |
| Rat | ||
| Mettl3 | 5′-CTTTAGCATCTGGTCTGGGCT-3′ | 5′-CCTTCTTGCTCTGCTGTTCCT-3′ |
| Mettl14 | 5′-CTGGACCCACATTTGCGAGC-3′ | 5′-GGAAGCCCTGCAAGTTTCTCT-3′ |
| Mettl4 | 5′-CTCGCCGAAGTTCTGAAAGACTA-3′ | 5′-AAACGAGCTGGGGTAAAGGC-3′ |
| Wtap | 5′-TAAGCTTGCAGAGCCCCCAC-3′ | 5′-CATCTTGTACCCCGAGACGC-3′ |
| Alkbh5 | 5′-TGAGATCCCGGAATGGGTGC-3′ | 5′-CCGAAGCAAAGTGCCGAGTC-3′ |
| Fto | 5′-TCATGGGACATCGAGACGCC-3′ | 5′-TCCAAGGTGCCTGTTGAGCA-3′ |
| Ythdf1 | 5′-GGACAGTCCAATCCGAGTAACA-3′ | 5′-GTGAGATACGGGATGGGAGG-3′ |
| Ythdc1 | 5′-TGCCAAAGCAAAGGGTGTATG-3′ | 5′-TGATGACAATCTGGCAAAACCTT-3′ |
| Atg3 | 5′-GAGGCTACCCTAGACACCAGA-3′ | 5′-TGTTAAAGGCTGCCGTTGCT-3′ |
| Atg4a | 5′-TTCGCCTGGGCATAAACCAA-3′ | 5′-GAAGGTCTGGGTTGTGTGAGG-3′ |
| Atg5 | 5′-TGATCCCGGTAGACCCAACC-3′ | 5′-CCACACGTCTCGAAGCACAT-3′ |
| Atg7 | 5′-GCGGATGTATGGACCCCAAA-3′ | 5′-GGAGATCTTGGCGTTGTCCA-3′ |
| Becn1 | 5′-TTGGCCAATAAGATGGGTCTGAA-3′ | 5′-TGTCAGGGACTCCAGATACGAGTG-3′ |
| Atg9a | 5′-GCGAGGCTGGTAACTGGAATC-3′ | 5′-TACGCATCGCGAGCTCACTT-3′ |
| Atg12 | 5′-CTGTCCAAGCACTCATCGACT-3′ | 5′-ATCCCCATGCCTGTGATTTGC-3′ |
| Atg14 | 5′-GCCATGGAAGGAAAACGGCT-3′ | 5′-AAACACGCCAACCGATCGTA-3′ |
| Atg16 | 5′-AATATCTTTGGGAGACGCTCTGTC-3′ | 5′-CTGCATTGACCTCTCCGTCAT-3′ |
| Actb | 5′-TTCTACAATGAGCTGCGTGTG-3′ | 5′-GGGGTGTTGAAGGTCTCAAA-3′ |