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. 2021 Oct 1;22(19):10678. doi: 10.3390/ijms221910678

Table 1.

Primer sequences for qPCR analysis.

Gene Forward Reverse
mRNA expression
β-Actin 5′-TGTGATGGTGGGAATGGGTCAGAA 5′-TGTGGTGCCAGATCTTCTCCATGT
Ppar-alpha 5′-CACAGACACCCTCTCTCCAG 5′-AGCCCTTACAGCCTTCACAT
Epigenetic Marks
HDAC1 5′-CACAGACACCCTCTCTCCAG 5′-AGCCCTTACAGCCTTCACAT
HDAC2 5′-GCTTGCCATCCTCGAATTAC 5′-CCCTCAAGTCTCCTGTTCCA
MeCP2 5′-GGTTGTCTCCACTGCTACTTAC 5′-GCTAACTTGGGTGCTGATCT
TET1 5′-TTGCCCAGACCATAAGGAAC 5′-GTGGTGACACTCATGGCATC
TET2 5′-GTTCTCAACGAGCAGGAAGG 5′-TGAGATGCGGTACTCTGCAC
TET3 5′-TCCGGATTGAGAAGGTCATC 5′- CCAGGCCAGGATCAAGATAA
DNMT1 5′-CCACCACCAAGCTGGTCTAT 5′-TGCCACCAAACTTCACCATA
DNMT3a
DNMT3b
Toll-Like Receptors
5′-ACCAGGCCACCTACAACAAG
5′-ACTTGGTGATTGGTGGAAGC
5′-TGCTTGTTCTGCACTTCCAC
5′-CCAGAAGAATGGACGGTTGT
TLR4 5′-GGCAGCAGGTGGAATTGTAT 5′-AGGATTCGAGGCTTTTCCAT
Inflammatory marks
TNFα 5′- ACGGCATGGATCTCAAAGAC 5′-GTGGGTGAGGAGCACGTAGT
MCP-1 5′-CCCAATGAGTAGGCTGGAGA 5′-TCTGGACCCATTCCTTCTTG
NFkB1 5′- CACCTAGCTGCCAAAGAAGG 5′ GCAGGCTATTGCTCATCACA
NFkB2 5′- GATCTCCCGAATGGACAAGA 5′ GAACCGAACCTCAATGTCGT
Ppar-alpha gene
(−50 to +31 bp) 5′- GGAGGGGAGGGGACTCG 5′- CGCGTGTGCCCTTCCTAG
(+9 +149 bp) 5′- CAGCCACTGGAGAGGGCACA 5′- CTCCAGTTCCAGGACTCCAC
(+1715 +1813 bp) 5′- TTCAAAAAATGGTGGACCTT 5′- TCTTGCAACAGTGGGTGC