Table 3.

Markers specific to the alien chromosomes of SN19647.

Markers	Homeologous groups	Sequences
CINAU851	1	F: 5′-TCTTCGTATCAGGCTTTGCTT-3′
		R: 5′-ACCTTGCGGATCCTTCTCAA-3′
CINAU857	1	F: 5′-GGGCATGCTCTTTCAACGG-3′
		R: 5′-TCATTTTCCAAACACCCTCAGT-3′
CINAU859	1	F: 5′-ATGCAGAGGATGGTCTTCGT-3′
		R: 5′-AGTCGATGAGGCTCTTATTTGT-3′
CINAU862	1	F: 5′-AGCCTGTCTCGGTGGTAAAA-3′
		R: 5′-CTGGAGTAGACAGTGCGTTTG-3′
CINAU865	1	F: 5′-TTCCGAATGCCTGCTTGTTT-3′
		R: 5′-ACACACATGGAACTCTTCATGA-3′
CINAU866	1	F: 5′-TCCAATCATTGCGCCAAATCT-3′
		R: 5′-GCAGTGTCCAAAAGTCCCTT-3′
CINAU870	1	F: 5′-TGTTCCGTGGAGATATCTTCCA-3′
		R: 5′-GGAAGGCCATCTGAATCAATTAC-3′
CINAU880	1	F: 5′-TGGCAATGTCTGTAGCCATC-3′
		R: 5′-GAACTCAAGCCGTGTCATGG-3′
CINAU889	1	F: 5′-TGTTCCAGTTCGAGCAAGAC-3′
		R: 5′-AGGGATCAAGTGGAGAGTGA-3′
CINAU890	1	F: 5′-GTTCACGTGCTGCTGAGTAT-3′
		R: 5′-ACCCGTCATCTCTGTGAGTG-3′
Xmag3030	1	F: 5′-AAAGTGGCGTCCTTCTCTTC-3′
		R: 5′-TGGTGACGATGGCTGACTT-3′
BE405232	1	F: 5′-TAGGCAAGTTGCTCTGCTGT-3′
		R: 5′-GATTTTGGGTTGCTCAGCTT-3′
Xgwm268	1	F: 5′-AGGGGATATGTTGTCACTCCA-3′
		R: 5′-TTATGTGATTGCGTACGTACCC-3′
SWES650	1	F: 5′-GCCGTGCTCCCGTAAACA-3′
		R: 5′-GCTTCACCGACGCAACCT-3′
TNAC1021-TaqI	1	F: 5′-CTCATGCATGCGTTTGTTAAA-3′
		R: 5′-CCAGCTGAAACAAGCATCTTC-3′
BG313767	1	F: 5′-GAGGCGTTCTTAAGACGGTG-3′
		R: 5′-GGTGTCAAAAACTTCGCCAT-3′
TNAC1026-HaeIII	1	F: 5′-GGGATAGAACTCTGGGACTTCA-3′
		R: 5′-AGTGCCAGGGCATAATACAGC-3′
CINAU971	2	F: 5′-GAGGGCAGCTTCGACGAC-3′
		R: 5′-CGGCTGGATCACTTCTTCC-3′
CINAU1616	7	F: 5′-TGGCCTCAAGTCTCAAGGTT-3′
		R: 5′-ATCCGGCCGTCCAGAAAATA-3′