TABLE 5.

Specificity and characteristics of species-specific primer pairs

Primer	Sequence (5′-3′)	Specificity		Annealing temp (°C)
		Positive PCR result	Negative PCR result
OX 31	TGA CTT GGA TGA GAC CTT GGC G	F. oxysporum 95, 82, and 9026	F. moniliforme, F. solani, F. oxysporum IP 625.72, F. proliferatum, F. dimerum, F. subglutinans, F. semitectum, and F. chlamydosporum	66
OX 32	CAG GAT TTA CCG ACA CAG CTT TTG
					OX 41	GTA GGA AAA ACA ATT GCT CAG TCG	F. oxysporum 9582 and IP 625.72	F. moniliforme, F. solani, F. oxysporum 9026, F. proliferatum, F. dimerum, F. subglutinans, F. semitectum, and F. chlamydosporum	66
					OX 42	AAG AGA GTG TGT AGT GGT GTG G
										OX 1	GTC ACG ACA TTT TCA CAA GCT G	F. moniliforme, F. oxysporum, F. proliferatum IP 2240.94, and F. subglutinans	F. solani, F. proliferatum IP 2290.94, IP 2296.95, and 68G, F. dimerum, F. chlamydosporum, and F. semitectum	63
OX 2	GGT CTC TCG ATA ACT TTG ACA G
		SOL 31	GCT ACC GAG GCC ATC AAT TCA TG	F. solani IP 2451.98, IP 1195.79, and IP 2330.95						F. moniliforme, F. solani IP 1984.87, F. oxysporum, F. proliferatum, F. subglutinans, F. semitectum, F. dimerum, and F. chlamydosporum	62
		SOL 32	TGA TGT TGT ACT TCT CCT TGC CC
					MON 1	GAG AGC TGG ATG TAC GAA TG	F. moniliforme, F. oxysporum, F. solani, F. subglutinans, and F. proliferatum	F. semitectum, F. dimerum, and F. chlamydosporum	60
MON 2	CAC AGA GAT GGT TCA CTG AG