Table 3.

Correlation analysis between NCF1, NCF2, and NCF4 and gene markers of immune cells.

Description	Gene markers	NCF1				NCF2				NCF4
		None		Purity		None		Purity		None		Purity
		Cor	p	Cor	p	Cor	p	Cor	p	Cor	p	Cor	p
CD8 T cell	CD8A	0.612	∗∗∗	0.574	∗∗∗	0.436	∗∗∗	0.393	∗∗∗	0.482	∗∗∗	0.403	∗∗∗
	CD8B	0.606	∗∗∗	0.572	∗∗∗	0.405	∗∗∗	0.362	∗∗∗	0.488	∗∗∗	0.424	∗∗∗
T cell (general)	CD3D	0.675	∗∗∗	0.642	∗∗∗	0.446	∗∗∗	0.399	∗∗∗	0.601	∗∗∗	0.536	∗∗∗
	CD3E	0.694	∗∗∗	0.661	∗∗∗	0.462	∗∗∗	0.413	∗∗∗	0.592	∗∗∗	0.527	∗∗∗
	CD2	0.702	∗∗∗	0.672	∗∗∗	0.510	∗∗∗	0.471	∗∗∗	0.600	∗∗∗	0.538	∗∗∗
B cell	CD19	0.448	∗∗∗	0.404	∗∗∗	0.282	∗∗∗	0.247	∗∗∗	0.536	∗∗∗	0.492	∗∗∗
	CD79A	0.503	∗∗∗	0.455	∗∗∗	0.316	∗∗∗	0.265	∗∗∗	0.538	∗∗∗	0.482	∗∗∗
Monocyte	CD86	0.735	∗∗∗	0.715	∗∗∗	0.825	∗∗∗	0.826	∗∗∗	0.704	∗∗∗	0.679	∗∗∗
	CD115 (CSF1R)	0.684	∗∗∗	0.665	∗∗∗	0.685	∗∗∗	0.677	∗∗∗	0.738	∗∗∗	0.720	∗∗∗
TAM	CCL2	0.129	∗∗	0.087	0.062	0.182	∗∗∗	0.154	∗∗	0.130	∗∗	0.077	0.100
	CD68	0.545	∗∗∗	0.528	∗∗∗	0.613	∗∗∗	0.618	∗∗∗	0.484	∗∗∗	0.493	∗∗∗
	IL10	0.527	∗∗∗	0.469	∗∗∗	0.639	∗∗∗	0.603	∗∗∗	0.600	∗∗∗	0.558	∗∗∗
M1 macrophage	INOS (ISYNA1)	-0.070	0.105	-0.113	∗	-0.198	∗∗∗	-0.238	∗∗∗	0.068	0.116	0.023	0.622
	IRF5	0.524	∗∗∗	0.522	∗∗∗	0.442	∗∗∗	0.463	∗∗∗	0.406	∗∗∗	0.411	∗∗∗
	cox2 (PTGS2)	-0.015	0.733	-0.057	0.219	0.108	∗	0.089	0.056	0.163	∗∗∗	0.117	∗
M2 macrophage	CD163	0.483	∗∗∗	0.458	∗∗∗	0.671	∗∗∗	0.664	∗∗∗	0.567	∗∗∗	0.551	∗∗∗
	VSIG4	0.597	∗∗∗	0.578	∗∗∗	0.636	∗∗∗	0.624	∗∗∗	0.703	∗∗∗	0.686	∗∗∗
	MS4A4A	0.530	∗∗∗	0.496	∗∗∗	0.698	∗∗∗	0.693	∗∗∗	0.646	∗∗∗	0.619	∗∗∗
Neutrophils	CD66b (CEACAM8)	0.039	0.374	0.045	0.335	0.113	∗∗	0.136	∗∗	0.074	0.087	0.105	∗
	CD11b (ITGAM)	0.711	∗∗∗	0.690	∗∗∗	0.780	∗∗∗	0.767	∗∗∗	0.657	∗∗∗	0.637	∗∗∗
	CCR7	0.540	∗∗∗	0.496	∗∗∗	0.463	∗∗∗	0.429	∗∗∗	0.579	∗∗∗	0.540	∗∗∗
Natural killer cell	KIR2DL1	0.125	∗∗	0.108	∗	0.102	∗	0.053	0.260	0.096	∗	0.033	0.481
	KIR2DL3	0.134	∗∗	0.152	∗∗	0.131	∗∗	0.118	∗	0.126	∗∗	0.110	∗
	KIR2DL4	0.273	∗∗∗	0.260	∗∗∗	0.169	∗∗∗	0.123	∗∗	0.282	∗∗∗	0.239	∗∗∗
	KIR2DS4	0.075	0.082	0.063	0.175	0.038	0.386	-0.005	0.914	0.093	∗	0.072	0.120
	KIR3DL1	0.121	∗∗	0.144	∗∗	0.131	∗∗	0.116	∗	0.088	∗	0.075	0.107
	KIR3DL2	0.184	∗∗∗	0.174	∗∗∗	0.110	∗	0.091	0.051	0.165	∗∗∗	0.146	∗∗
	KIR3DL3	0.130	∗∗	0.098	∗	0.073	0.092	0.056	0.231	0.144	∗∗	0.122	∗∗
Dendritic cell	HLA-DPA1	0.702	∗∗∗	0.672	∗∗∗	0.697	∗∗∗	0.680	∗∗∗	0.576	∗∗∗	0.522	∗∗∗
	HLA-DPB1	0.763	∗∗∗	0.749	∗∗∗	0.686	∗∗∗	0.667	∗∗∗	0.640	∗∗∗	0.609	∗∗∗
	HLA-DQB1	0.487	∗∗∗	0.442	∗∗∗	0.419	∗∗∗	0.376	∗∗∗	0.402	∗∗∗	0.341	∗∗∗
	HLA-DRA	0.731	∗∗∗	0.714	∗∗∗	0.750	∗∗∗	0.741	∗∗∗	0.612	∗∗∗	0.583	∗∗∗
	BDCA-1 (CD1C)	0.395	∗∗∗	0.345	∗∗∗	0.460	∗∗∗	0.419	∗∗∗	0.429	∗∗∗	0.379	∗∗∗
	BDCA-4 (NRP1)	-0.001	0.982	-0.064	0.167	0.212	∗∗∗	0.166	∗∗∗	0.050	0.247	-0.015	0.756
	CD11c (ITGAX)	0.655	∗∗∗	0.629	∗∗∗	0.676	∗∗∗	0.670	∗∗∗	0.645	∗∗∗	0.639	∗∗∗
Th1	T-bet (TBX21)	0.455	∗∗∗	0.434	∗∗∗	0.297	∗∗∗	0.261	∗∗∗	0.426	∗∗∗	0.383	∗∗∗
	STAT4	0.454	∗∗∗	0.404	∗∗∗	0.373	∗∗∗	0.342	∗∗∗	0.523	∗∗∗	0.465	∗∗∗
	IFN-γ (IFNG)	0.592	∗∗∗	0.553	∗∗∗	0.410	∗∗∗	0.365	∗∗∗	0.453	∗∗∗	0.382	∗∗∗
	TNF-α (TNF)	0.478	∗∗∗	0.475	∗∗∗	0.388	∗∗∗	0.384	∗∗∗	0.462	∗∗∗	0.437	∗∗∗
	STAT1	0.588	∗∗∗	0.537	∗∗∗	0.633	∗∗∗	0.605	∗∗∗	0.428	∗∗∗	0.352	∗∗∗
Th2	GATA3	0.212	∗∗∗	0.234	∗∗∗	0.133	∗∗	0.118	∗	0.222	∗∗∗	0.188	∗∗∗
	STAT6	0.150	∗∗∗	0.167	∗∗∗	0.189	∗∗∗	0.206	∗∗∗	0.099	∗	0.138	∗∗
	STAT5A	0.629	∗∗∗	0.614	∗∗∗	0.598	∗∗∗	0.583	∗∗∗	0.535	∗∗∗	0.495	∗∗∗
	IL13	0.053	0.219	0.038	0.420	-0.063	0.145	-0.061	0.194	0.173	∗∗∗	0.165	∗∗∗
Tfh	BCL6	-0.029	0.500	-0.034	0.465	0.029	0.499	0.028	0.544	0.091	∗	0.098	∗