Skip to main content
. 2021 Oct 26;10(1):493–504. doi: 10.1080/21623945.2021.1978157

Table 2.

Top 20 DMCs, grouped by adipogenesis stage

OD vs OND CpG ID OND Beta mean OD Beta mean Delta Beta Chromosome Gene symbol Genomic region P value
MSC cg02332293 0.710 0.889 0.180 5   IGR 7.44E-08
cg26480858 0.305 0.201 0.103 7 THSD7A Body 7.42E-05
cg05170452 0.713 0.829 0.115 5   IGR 9.31E-05
cg16626954 0.513 0.406 0.107 3   IGR 0.00015
cg24056885 0.500 0.356 0.144 3 ABCC5AS1 TSS200 0.00015
cg12771637 0.555 0.657 0.101 11   IGR 0.00021
cg25635251 0.531 0.664 0.133 11   IGR 0.00028
cg13482309 0.393 0.571 0.178 9 OR1B1 1stExon 0.00028
cg18830697 0.747 0.849 0.102 6 RIMS1 TSS200 0.00052
cg11086466 0.762 0.608 0.154 6 RNF182 5’UTR 0.00054
cg18454042 0.581 0.694 0.113 7 SDK1 Body 0.00063
cg18116804 0.525 0.368 0.156 10 PLXDC2 Body 0.00064
cg18860301 0.634 0.466 0.168 6 RNF182 5’UTR 0.0007
cg06121514 0.576 0.677 0.101 15 IPW Body 0.00071
cg14439102 0.544 0.442 0.102 9 GNAQ Body 0.00075
cg06104343 0.761 0.631 0.130 17   IGR 0.00082
cg03915559 0.592 0.455 0.136 10 LGI1 Body 0.00082
cg00435063 0.449 0.553 0.104 7 PTPRN2 Body 0.0009
cg10284704 0.773 0.645 0.128 15   IGR 0.0009
cg03962019 0.799 0.689 0.110 1   IGR 0.00095
PreA cg17292337 0.092 0.351 0.258 12   IGR 1.62E-05
cg20790798 0.456 0.611 0.156 5   IGR 1.99E-05
cg24517467 0.444 0.602 0.158 7   IGR 2.12E-05
cg14950747 0.915 0.796 0.118 19 ZFR2 Body 7.18E-05
cg24449463 0.480 0.280 0.200 1 DCAF6 Body 9.36E-05
cg23084986 0.748 0.645 0.103 1 RAB42 TSS1500 0.00011
cg07415266 0.562 0.686 0.124 2 IL18RAP Body 0.00017
cg27216788 0.266 0.459 0.193 16 ST3GAL2 3’UTR 0.00025
cg06821828 0.262 0.548 0.286 14   IGR 0.00026
cg20253542 0.872 0.718 0.155 7   IGR 0.00026
cg06259934 0.48 0.322 0.162 10 ZMIZ1 Body 0.0003
cg02721751 0.837 0.651 0.186 6 SLC44A4 Body 0.00032
cg27614534 0.855 0.710 0.145 18 ALPK2 TSS1500 0.00035
cg07342647 0.847 0.669 0.178 16   IGR 0.00041
cg04051335 0.641 0.479 0.162 5 C5orf62 TSS1500 0.00045
cg17071479 0.736 0.608 0.128 16 SRL Body 0.00046
cg26457868 0.495 0.340 0.155 10 SUFU Body 0.00053
cg17045772 0.859 0.738 0.122 1 CTPS TSS1500 0.00053
cg15397200 0.618 0.738 0.119 2   IGR 0.00053
cg05867245 0.563 0.872 0.310 20 ZBTB46 Body 0.00055
MA cg22960347 0.361 0.247 0.115 7   IGR 7.03E05
cg00216549 0.631 0.529 0.102 1 DDAH1 Body 0.00011
cg05146544 0.109 0.227 0.118 2   IGR 0.00023
cg24224080 0.331 0.220 0.111 5   IGR 0.00026
cg24449463 0.451 0.310 0.140 1 DCAF6 Body 0.00029
cg10354380 0.573 0.458 0.115 6 IL17F TSS200 0.00032
cg01911494 0.290 0.177 0.113 16 LMF1 Body 0.00049
cg27082921 0.803 0.655 0.147 19 ATP8B3 Body 0.00053
cg11613005 0.340 0.443 0.103 5 GPR151 1stExon 0.00068
cg19534681 0.120 0.237 0.117 2   IGR 0.00073
cg17487381 0.391 0.272 0.119 9   IGR 0.00098
cg25635251 0.497 0.652 0.156 11   IGR 0.00099
cg23989344 0.719 0.591 0.128 10 ST8SIA6 Body 0.00107
cg00034755 0.785 0.678 0.107 22   IGR 0.00114
cg22891588 0.700 0.594 0.105 5 LRRC70 1stExon 0.00131
cg04676645 0.820 0.704 0.116 8 CLU Body 0.00166
cg16246747 0.722 0.607 0.115 2 ACOXL 5’UTR 0.00176
cg00945409 0.400 0.222 0.177 10 ZMIZ1AS1 Body 0.0019
cg19868364 0.560 0.663 0.103 14   IGR 0.00203
cg06159404 0.188 0.352 0.164 10   IGR 0.00217

DMC: differential methylation CpG sites,

Transcription starts sites (TSS 200 pb1500 pb), intergenic regions (IGR)