Table 5.
Correlation analysis between MMP2 and MMP9 expression and related genes and markers of infiltrating immune cells using the TIMER database. None, correlation without adjustment; purity, correlation adjusted by purity. r, the categorized Pearson’s correlation coefficient, was scored as follows: (---), r from −1.0 to −0.5, strong negative association; (--), −0.5 to −0.3, weak negative association; (-), −0.3 to 0.1, little association. (+), +0.1 to 0.3, little association; (++) +0.3 to +0.5, weak positive association; (+++), +0.5 to +1.0, strong positive association. p-value indicates statistical significance.
| MMP2 | MMP9 | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| Markers | None | Purity | None | Purity | |
| r | r | r | r | ||
| CD8+ T cell | CD8A | (++) | (--) | (++) | (--) |
| CD8B | (+) | (-) | (+) | (-) | |
| CD3D | (++) | (--) | (++) | (--) | |
| T cell (general) | CD3E | (++) | (--) | (++) | (--) |
| CD2 | (++) | (--) | (++) | (--) | |
| CD19 | (++) | (--) | (+) | (--) | |
| B cell | CD79A | (++) | (--) | (++) | (--) |
| CD86 | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| Monocyte | CSF1R | (+++) | (--) | (+++) | (--) |
| CCL2 | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| TAM | CD68 | (+++) | (--) | (+++) | (--) |
| IL10 | (+++) | (--) | (++) | (--) | |
| NOS2 | (-) | (-) | |||
| M1 macrophage | IRF5 | (++) | (++) | ||
| PTGS2 | (++) | (-) | (+) | (-) | |
| CD163 | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| M2 macrophage | VSIG4 | (+++) | (--) | (+++) | (--) |
| MS4A4A | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| CEACAM8 | (-) | (-) | (-) | ||
| Neutrophils | ITGAM | (+++) | (--) | (+++) | (--) |
| CCR7 | (++) | (--) | (++) | (--) | |
| KIR2DL1 | (+) | (-) | (+) | (-) | |
| KIR2DL3 | (+) | (-) | (+) | (-) | |
| KIR2DL4 | (+) | (--) | (+) | (--) | |
| Natural killer cells | KIR3DL1 | (+) | (-) | (+) | (-) |
| KIR3DL2 | (+) | (-) | (+) | (-) | |
| KIR3DL3 | (+) | ||||
| KIR2DS4 | (+) | (-) | (+) | (-) | |
| HLA-DPB1 | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| HLA-DQB1 | (++) | (--) | (++) | (--) | |
| HLA-DRA | (+++) | (--) | (++) | (--) | |
| Dendritic cell | HLA-DPA1 | (+++) | (--) | (+++) | (--) |
| CD1C | (++) | (--) | (++) | (--) | |
| NRP1 | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| ITGAX | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| TBX21 | (++) | (--) | (++) | (--) | |
| STAT4 | (++) | (--) | (++) | (--) | |
| Th1 | STAT1 | (++) | (-) | (++) | (-) |
| IFNG | (+) | (-) | (+) | (-) | |
| TNF | (++) | (-) | (++) | (-) | |
| GATA3 | (+++) | (--) | (++) | (--) | |
| Th2 | STAT6 | ||||
| STAT5A | (++) | (-) | (++) | (-) | |
| IL13 | (++) | (-) | (+) | (-) | |
| Tfh | BCL6 | (+++) | (--) | (+++) | (--) |
| STAT3 | (++) | (-) | (++) | (-) | |
| Th17 | IL17A | ||||
| FOXP3 | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| CCR8 | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| T reg | STAT5B | (++) | (+) | ||
| TGFB1 | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| PDCD1 | (++) | (--) | (++) | (--) | |
| CTLA4 | (+++) | (--) | (++) | (--) | |
| T cell exhaustion | LAG3 | (++) | (--) | (++) | (--) |
| HAVCR2 | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| GZMB | (+) | ||||
| CD14 | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| FERMT3 | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| GPSM3 | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| Myeloid-derived suppressor cells |
IL18BP | (+++) | (--) | (+++) | (--) |
| PSAP | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| PTGES2 | (-) | (-) | |||
| CFD | (+) | (-) | (+) | (-) | |
| MBL2 | (+) | (-) | (+) | (-) | |
| C2 | (+) | (-) | (+) | (-) | |
| C5 | (+) | ||||
| Complement | C8G | (-) | |||
| MASP2 | |||||
| C3 | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |
| C1S | (+++) | (--) | (+++) | (--) | |