Table 2.
Example of raw GFP+ tumor cell counts used to calculate invasion ratio
| Day | Chip | Condition | Area of chip | GFP + cells in bottom channel (counts) | GFP + cells in top channel (counts) | Ratio bottom/top | Ratio chip | Normalized to D0 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| D0 | Chip 1 | Caco2 + HCT116 | Region 1 | 1.00000 | 483.00000 | 0.00207 | 0.00185 | 1.00000 |
| Region 2 | 1.00000 | 516.00000 | 0.00194 | |||||
| Region 3 | 1.00000 | 542.00000 | 0.00185 | |||||
| Region 4 | 1.00000 | 611.00000 | 0.00164 | |||||
| Region 5 | 1.00000 | 574.00000 | 0.00174 | |||||
| Region 6 | 1.00000 | 520.00000 | 0.00192 | |||||
| Chip 2 | Caco2 + HCT116 | Region 1 | 1.00000 | 535.00000 | 0.00187 | 0.00193 | 1.00000 | |
| Region 2 | 1.00000 | 467.00000 | 0.00214 | |||||
| Region 3 | 1.00000 | 562.00000 | 0.00178 | |||||
| Region 4 | 1.00000 | 553.00000 | 0.00181 | |||||
| Region 5 | 1.00000 | 471.00000 | 0.00212 | |||||
| Region 6 | 1.00000 | 526.00000 | 0.00190 | |||||
| Chip 3 | Caco2 + HCT116 | Region 1 | 1.00000 | 675.00000 | 0.00148 | 0.00159 | 1.00000 | |
| Region 2 | 1.00000 | 642.00000 | 0.00156 | |||||
| Region 3 | 1.00000 | 654.00000 | 0.00153 | |||||
| Region 4 | 1.00000 | 590.00000 | 0.00169 | |||||
| Region 5 | 1.00000 | 595.00000 | 0.00168 | |||||
| Region 6 | 1.00000 | 608.00000 | 0.00164 | |||||
| Chip 4 | Caco2 + HCT116 | Region 1 | 1.00000 | 542.00000 | 0.00185 | 0.00198 | 1.00000 | |
| Region 2 | 1.00000 | 526.00000 | 0.00190 | |||||
| Region 3 | 1.00000 | 511.00000 | 0.00196 | |||||
| Region 4 | 1.00000 | 475.00000 | 0.00211 | |||||
| Region 5 | 1.00000 | 480.00000 | 0.00208 | |||||
| Region 6 | 1.00000 | 499.00000 | 0.00200 | |||||
| Chip 5 | Caco2 + HCT116 | Region 1 | 1.00000 | 733.00000 | 0.00136 | 0.00129 | 1.00000 | |
| Region 2 | 1.00000 | 798.00000 | 0.00125 | |||||
| Region 3 | 1.00000 | 772.00000 | 0.00130 | |||||
| Region 4 | 1.00000 | 715.00000 | 0.00140 | |||||
| Region 5 | 1.00000 | 857.00000 | 0.00117 | |||||
| Region 6 | 1.00000 | 764.00000 | 0.00131 | |||||
| Chip 6 | Caco2 + HCT116 | Region 1 | 1.00000 | 759.00000 | 0.00132 | 0.00138 | 1.00000 | |
| Region 2 | 1.00000 | 739.00000 | 0.00135 | |||||
| Region 3 | 1.00000 | 727.00000 | 0.00138 | |||||
| Region 4 | 1.00000 | 777.00000 | 0.00129 | |||||
| Region 5 | 1.00000 | 741.00000 | 0.00135 | |||||
| Region 6 | 1.00000 | 620.00000 | 0.00161 | |||||
| D6 | Chip 1 | Caco2 + HCT116 | Region 1 | 7.00000 | 3699.00000 | 0.00232 | 0.00625 | 3.38191 |
| Region 2 | 76.00000 | 5893.00000 | 0.00202 | |||||
| Region 3 | 10.00000 | 2424.00000 | 0.00221 | |||||
| Region 4 | 5.00000 | 2801.00000 | 0.00182 | |||||
| Region 5 | 25.00000 | 4096.00000 | 0.00190 | |||||
| Region 6 | 5.00000 | 1563.00000 | 0.00169 | |||||
| Chip 2 | Caco2 + HCT116 | Region 1 | 91.00000 | 2532.00000 | 0.00170 | 0.01088 | 5.64719 | |
| Region 2 | 56.00000 | 4743.00000 | 0.00175 | |||||
| Region 3 | 66.00000 | 4292.00000 | 0.00167 | |||||
| Region 4 | 30.00000 | 5522.00000 | 0.00180 | |||||
| Region 5 | 18.00000 | 4639.00000 | 0.00164 | |||||
| Region 6 | 10.00000 | 3178.00000 | 0.00191 | |||||
| Chip 3 | Caco2 + HCT116 | Region 1 | 91.00000 | 2455.00000 | 0.00232 | 0.01187 | 7.44741 | |
| Region 2 | 123.00000 | 5594.00000 | 0.00202 | |||||
| Region 3 | 57.00000 | 6407.00000 | 0.00221 | |||||
| Region 4 | 14.00000 | 3121.00000 | 0.00182 | |||||
| Region 5 | 16.00000 | 4664.00000 | 0.00190 | |||||
| Region 6 | 18.00000 | 4630.00000 | 0.00169 | |||||
| Chip 4 | Caco2 + HCT116 | Region 1 | 3.00000 | 2738.00000 | 0.00170 | 0.00820 | 4.14344 | |
| Region 2 | 49.00000 | 4631.00000 | 0.00175 | |||||
| Region 3 | 75.00000 | 5932.00000 | 0.00167 | |||||
| Region 4 | 20.00000 | 2420.00000 | 0.00180 | |||||
| Region 5 | 30.00000 | 4402.00000 | 0.00164 | |||||
| Region 6 | 15.00000 | 3301.00000 | 0.00191 | |||||
| Chip 5 | Caco2 + HCT116 | Region 1 | 8.00000 | 3571.00000 | 0.00232 | 0.00789 | 6.09854 | |
| Region 2 | 5.00000 | 3688.00000 | 0.00202 | |||||
| Region 3 | 98.00000 | 3223.00000 | 0.00221 | |||||
| Region 4 | 13.00000 | 3852.00000 | 0.00182 | |||||
| Region 5 | 27.00000 | 3689.00000 | 0.00190 | |||||
| Region 6 | 21.00000 | 3783.00000 | 0.00169 | |||||
| Chip 6 | Caco2 + HCT116 | Region 1 | 10.00000 | 3929.00000 | 0.00170 | 0.00783 | 5.69683 | |
| Region 2 | 39.00000 | 3437.00000 | 0.00175 | |||||
| Region 3 | 9.00000 | 3541.00000 | 0.00167 | |||||
| Region 4 | 28.00000 | 3159.00000 | 0.00180 | |||||
| Region 5 | 18.00000 | 3540.00000 | 0.00164 | |||||
| Region 6 | 59.00000 | 3200.00000 | 0.00191 |