Table 1.
Description | Gene markers | CRYAB | CALR | DNAJB4 | HSPB6 | KDELR3 | FBXO6 | CREB3L3 | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
GEPIA | |||||||||||||||
R | P | R | P | R | P | R | P | R | P | R | P | R | P | ||
B cell | CD19 | 0.41 | *** | 0.12 | * | 0.13 | ** | 0.46 | *** | 0.27 | *** | 0.24 | *** | 0.15 | ** |
CD79A | 0.42 | *** | 0.056 | ns | 0.14 | ** | 0.46 | *** | 0.25 | *** | 0.18 | *** | 0.11 | * | |
MS4A1 | 0.36 | *** | − 0.018 | ns | 0.17 | *** | 0.46 | *** | 0.19 | *** | 0.13 | * | 0.16 | ** | |
CD8+ T cell | CD8A | 0.28 | *** | 0.24 | *** | 0.3 | *** | 0.18 | *** | 0.18 | *** | 0.46 | *** | 0.1 | * |
CD8B | 0.23 | *** | 0.27 | *** | 0.25 | *** | 0.19 | *** | 0.16 | ** | 0.39 | *** | 0.08 | ns | |
IL2RA | 0.45 | *** | 0.31 | *** | 0.41 | *** | 0.32 | *** | 0.3 | *** | 0.38 | *** | 0.12 | * | |
M1 macrophages | PTGS2 | 0.16 | ** | 0.11 | * | 0.34 | *** | 0.12 | * | 0.22 | *** | 0.13 | * | 0.072 | ns |
NOS2 | 0.12 | * | − 0.081 | ns | 0.1 | * | 0.26 | *** | 0.11 | * | 0.14 | ** | 0.13 | ** | |
M2 macrophages | CD163 | 0.54 | *** | 0.36 | *** | 0.35 | *** | 0.44 | *** | 0.42 | *** | 0.34 | *** | 0.094 | ns |
CD209 | 0.52 | *** | 0.29 | *** | 0.43 | *** | 0.39 | *** | 0.33 | *** | 0.31 | *** | 0.085 | ns | |
MRC1 | 0.51 | *** | 0.28 | *** | 0.39 | *** | 0.4 | *** | 0.39 | *** | 0.29 | *** | 0.11 | * | |
M0 macrophages | CD14 | 0.56 | *** | 0.35 | *** | 0.38 | *** | 0.39 | *** | 0.31 | *** | 0.33 | *** | 0.057 | ns |
CD33 | 0.53 | *** | 0.31 | *** | 0.34 | *** | 0.45 | *** | 0.33 | *** | 0.29 | *** | 0.11 | * | |
ITGAX | 0.53 | *** | 0.26 | *** | 0.41 | *** | 0.41 | *** | 0.36 | *** | 0.34 | *** | 0.12 | * | |
TAM | CCL2 | 0.54 | *** | 0.23 | *** | 0.34 | *** | 0.52 | *** | 0.41 | *** | 0.27 | *** | 0.14 | ** |
CD68 | 0.31 | *** | 0.29 | *** | 0.44 | *** | 0.14 | ** | 0.11 | * | 0.37 | *** | 0.0091 | ns | |
CD86 | 0.5 | *** | 0.31 | *** | 0.45 | *** | 0.32 | *** | 0.26 | *** | 0.38 | *** | 0.083 | ns | |
Neutrophil | CD55 | 0.13 | ** | 0.014 | ns | 0.21 | *** | 0.14 | ** | 0.34 | *** | 0.016 | ns | 0.07 | ns |
FCGR3A | 0.49 | *** | 0.37 | *** | 0.4 | *** | 0.34 | *** | 0.39 | *** | 0.39 | *** | 0.094 | ns | |
ITGAM | 0.5 | *** | 0.33 | *** | 0.43 | *** | 0.39 | *** | 0.37 | *** | 0.35 | *** | 0.15 | ** | |
Natural killer cell | CD7 | 0.35 | *** | 0.27 | *** | 0.29 | *** | 0.24 | *** | 0.19 | *** | 0.47 | *** | 0.082 | ns |
KIR3DL1 | 0.19 | *** | 0.16 | ** | 0.19 | *** | 0.14 | ** | 0.14 | ** | 0.33 | *** | 0.11 | * | |
Dendritic cell | CD1C | 0.37 | *** | 0.0072 | ns | 0.26 | *** | 0.36 | *** | 0.0078 | ns | 0.018 | ns | 0.048 | ns |
THBD | 0.25 | *** | 0.057 | ns | 0.32 | *** | 0.048 | ns | − 0.038 | ns | 0.16 | ** | − 0.17 | *** | |
T cell exhaustion | CTLA4 | 0.36 | *** | 0.26 | *** | 0.31 | *** | 0.2 | *** | 0.19 | *** | 0.43 | *** | 0.12 | * |
LAG3 | 0.31 | *** | 0.36 | *** | 0.28 | *** | 0.15 | ** | 0.21 | *** | 0.47 | *** | 0.12 | * | |
PD-1 | 0.32 | *** | 0.27 | *** | 0.29 | *** | 0.23 | *** | 0.21 | *** | 0.48 | *** | 15 | ** | |
Treg | FOXP3 | 0.39 | *** | 0.24 | *** | 0.38 | *** | 0.29 | *** | 0.23 | *** | 0.39 | *** | 0.14 | ** |
IL7R | 0.51 | *** | 0.27 | *** | 0.42 | *** | 0.35 | *** | 0.35 | *** | 0.3 | *** | 0.075 | ns | |
NT5E | 0.4 | *** | 0.25 | *** | 0.39 | *** | 0.18 | *** | 0.27 | *** | 0.16 | ** | − 0.024 | ns | |
Th1 cell | CCR1 | 0.4 | *** | 0.36 | *** | 0.36 | *** | 0.32 | *** | 0.41 | *** | 0.34 | *** | 0.12 | * |
CCR5 | 0.37 | *** | 0.3 | *** | 0.35 | *** | 0.28 | *** | 0.29 | *** | 0.43 | *** | 0.15 | ** | |
IL12RB1 | 0.37 | *** | 0.28 | *** | 0.34 | *** | 0.25 | *** | 0.22 | *** | 0.46 | *** | 0.11 | * | |
Th2 cell | CCR4 | 0.35 | *** | 0.081 | ns | 0.38 | *** | 0.39 | *** | 0.25 | *** | 0.26 | *** | 0.17 | *** |
CCR8 | 0.34 | *** | 0.14 | ** | 0.46 | *** | 0.25 | *** | 0.28 | *** | 0.31 | *** | 0.18 | *** |
***P < 0.001, **P < 0.01, *P < 0.05, ns