Table 2. Amino acid sequence at the receptor binding site and potential glycosylation site.
| Virus | Amino acid sequence and position of receptor binding site | Potential glycosylation site | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 143 | 145 | 149 | 153 | 164 | 166-168 | 171 | 181 | 196 | 197 | 198 | 200 | 201 | 29 | 82 | 141 | 218 | 298 | 305 | 313 | 492 | 551 | ||||||||||||
| A/Duck/Hong Kong/Y280/97 | S | S | K | D | Q | NNA | I | G | D | T | T | T | N | STE | PSC | VSY | RTF | TTL | VSK | 0 | GTY | 0 | |||||||||||
| A/chicken/Beijing/1/1994 | T | . | . | . | . | D.. | V | . | . | . | V | . | . | ... | ... | .T. | ... | ... | ... | 0 | ... | 0 | |||||||||||
| A/chicken/Hong Kong/G9/1997 | . | . | . | . | . | ... | . | . | . | . | A | . | . | ... | ... | .s. | ... | ... | ... | 0 | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Shanghai/F/98 | . | . | . | . | . | ... | . | . | . | . | A | . | . | ... | ... | ... | ... | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/duck/Hong Kong/Y439/1997 | T | T | R | N | H | S.S | V | . | . | . | E | . | . | ... | ... | .T. | ... | ... | ... | 0 | ... | GSC | |||||||||||
| A/Quail/Hong Kong/G1/97 | T | T | R | G | . | SGF | . | . | Y | . | E | . | . | ... | ... | .T. | ... | ... | ... | 0 | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/76/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Environment/Jiangxi/E11/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | ... | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/22/2018 | . | D | T | N | R | DGN | T | . | . | D | . | R | . | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/81/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/61/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/127/2018 | . | D | T | G | R | .GE | T | . | . | D | . | R | G | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Shandong/C84/2018 | . | D | T | G | R | .GD | . | . | . | E | . | R | G | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Duck/Jiangxi/D10/2018 | . | D | T | N | R | DGN | T | . | . | D | . | R | ... | ... | .. | .. | ... | ... | CSK | ... | GSC | ||||||||||||
| A/Chicken/Shandong/C131/2018 | . | D | T | G | R | .GD | . | . | . | E | . | R | G | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/226/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/142/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/126/2018 | . | D | T | G | R | .GE | T | . | . | D | . | R | G | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/147/2018 | T | . | . | G | . | .G. | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/149/2018 | . | D | T | G | R | .GE | T | . | . | D | . | R | G | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/251/2018 | . | D | T | G | R | .GD | . | . | . | E | . | R | G | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Shandong/C54/2018 | . | D | T | G | R | ..D | . | . | . | E | . | R | G | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/95/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Shandong/C82/2018 | . | D | T | G | R | .GD | . | . | . | E | . | R | G | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/261/2018 | . | D | T | G | R | .GD | . | . | . | E | . | R | G | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/80/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/160/2018 | . | D | T | G | R | .GE | T | . | . | D | . | R | G | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Shandong/C107/2018 | . | D | T | G | R | .GD | . | . | . | E | . | R | G | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Shandong/C169/2018 | . | D | T | G | R | .GD | . | . | . | E | . | R | G | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Jiangxi/C15/2018 | . | D | T | N | R | DGN | T | . | . | D | . | R | . | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Shandong/C79/2018 | . | D | T | G | R | .GD | . | . | . | E | . | R | G | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Environment/Jiangxi/E15/2018 | . | D | T | N | R | DGN | T | . | . | D | . | R | . | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Jiangxi/C19/2018 | . | D | T | N | R | DGN | T | . | . | D | . | R | . | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Shandong/C80/2018 | . | D | T | G | R | .GD | . | . | . | E | . | R | G | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Jiangxi/C16/2018 | . | D | T | N | . | DGN | T | . | . | D | . | R | . | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/146/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/78/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Jiangxi/C11/2018 | . | . | . | . | . | ... | T | . | . | . | A | . | . | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Duck/Jiangxi/D13/2018 | . | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | A | . | . | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/131/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/92/2018 | . | . | . | . | . | ... | T | . | . | . | A | . | . | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Jiangxi/C14/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/63/2018 | . | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | A | . | . | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Shandong/C126/2018 | . | D | T | G | R | .GD | . | . | . | E | . | R | G | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/65/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/107/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Duck/Jiangxi/D1/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/90/2018 | . | D | T | N | R | DGN | T | . | . | D | . | R | . | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/169/2018 | . | D | T | G | R | .GD | . | . | . | E | . | R | G | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/77/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Jiangxi/C42/2018 | . | D | T | G | R | .GD | . | . | . | E | . | R | G | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Goose/Jiangxi/G1/2018 | T | . | . | . | . | ... | . | E | E | . | S | . | . | ... | ... | .T. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/152/2018 | . | D | T | N | R | DGN | T | . | . | D | . | R | . | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
| A/Chicken/Hubei/262/2018 | . | . | . | . | . | ... | T | . | . | . | A | . | . | ... | ... | .. | 0 | ... | ... | CSK | ... | GSC | |||||||||||
Notes.
“.” represents that the site at which the amino acid is identical to A/Duck/Hong Kong/Y280/97 (H9N2) virus; “0” indicates a site at which the potential glycosylation site was absent.