TABLE 3.

The influence of the parameter of k (M.musculus in Dataset A).

Indices	Molecular function			Biological process				Cellular component
	1st rank	2nd rank	3rd rank	1st rank	2nd rank	3rd rank	4th rank	1st rank	2nd rank	3rd rank
Origin	0.28	0.12	0.10	0.39	0.23	0.13	0.09	1.63	0.45	0.24
BLAST 1	0.34	0.19	0.09	0.30	0.16	0.08	0.04	0.79	0.34	0.13
BLAST 5	0.43	0.26	0.13	0.45	0.22	0.12	0.08	0.98	0.38	0.18
BLAST 10	0.45	0.27	0.11	0.43	0.18	0.13	0.09	0.96	0.35	0.17
BLAST 15	0.41	0.21	0.13	0.42	0.20	0.11	0.09	0.92	0.33	0.19
BLAST+1	0.39	0.24	0.15	0.47	0.26	0.15	0.12	1.71	0.49	0.27
BLAST+5	0.47	0.29	0.23	0.56	0.30	0.18	0.14	2.02	0.67	0.32
BLAST+10	0.49	0.24	0.21	0.54	0.32	0.14	0.11	1.94	0.58	0.29
BLAST+15	0.46	0.27	0.20	0.49	0.34	0.15	0.12	1.86	0.62	0.33
FS 10	0.30	0.14	0.12	0.42	0.24	0.14	0.09	1.71	0.54	0.23
FS 30	0.33	0.15	0.15	0.47	0.28	0.16	0.12	2.13	0.61	0.27
FS 50	0.35	0.16	0.17	0.46	0.30	0.18	0.14	2.04	0.64	0.28
FS 100	0.32	0.18	0.12	0.45	0.27	0.17	0.15	1.95	0.57	0.26
FS+10	0.32	0.14	0.12	0.26	0.14	0.14	0.10	1.95	0.58	0.25
FS+30	0.39	0.16	0.15	0.52	0.30	0.16	0.14	2.23	0.70	0.30
FS+50	0.41	0.15	0.11	0.54	0.24	0.14	0.14	2.21	0.67	0.25
FS+100	0.38	0.18	0.16	0.50	0.27	0.16	0.13	2.07	0.64	0.27
RWR 10	0.25	0.13	0.11	0.41	0.21	0.14	0.09	1.86	0.54	0.24
RWR 30	0.32	0.15	0.13	0.49	0.26	0.16	0.11	2.23	0.61	0.30
RWR 50	0.31	0.16	0.11	0.47	0.21	0.17	0.12	2.33	0.58	0.27
RWR 100	0.29	0.15	0.15	0.44	0.22	0.16	0.14	2.12	0.55	0.30
RWR+10	0.29	0.14	0.13	0.47	0.23	0.15	0.12	2.13	0.57	0.29
RWR+30	0.35	0.15	0.16	0.52	0.28	0.18	0.12	2.45	0.64	0.33
RWR+50	0.34	0.16	0.15	0.49	0.28	0.14	0.13	2.36	0.62	0.32
RWR+100	0.31	0.15	0.15	0.46	0.25	0.16	0.12	2.23	0.58	0.36