TABLE 1.
Comparison of IS6110 typing, pTBN12 typing, and spoligotypinga
| IS6110 copy no. | IS6110 type (no. of isolates) | Spoligotype (no. of isolates) | pTBN12 type (no. of isolates) | Epidemiology (no. linked/no. available) |
|---|---|---|---|---|
| 2 | 1 (28) | A (17) | a (8) | 2/7 |
| b (2) | 0/1 | |||
| c (1) | 0/1 | |||
| d (3) | 3/3 | |||
| e (1) | 0/1 | |||
| f (1) | NAb | |||
| g (1) | 0/1 | |||
| B (6) | h (1) | 0/1 | ||
| i (1) | 0/1 | |||
| j (1) | 0/1 | |||
| k (1) | 0/1 | |||
| l (2) | 0/2 | |||
| C (1) | m (1) | 0/1 | ||
| D (1) | n (1) | 0/1 | ||
| E (1) | o (1) | 0/1 | ||
| F (1) | p (1) | 0/1 | ||
| G (1) | q (1) | 0/1 | ||
| 3 | 2 (5) | H (5) | r (5) | 2/4 |
| 3 (2) | A (2) | s (1) | 0/1 | |
| t (1) | NA | |||
| 4 (2) | I (1) | u (1) | NA | |
| J (1) | v (1) | NA | ||
| 4 | 5 (10) | B (2) | w (1) | 0/1 |
| x (1) | NA | |||
| K (4) | y (2) | NA | ||
| z (2) | 0/1 | |||
| L (2) | aa (2) | 2/2 | ||
| M (1) | bb (1) | 0/1 | ||
| N (1) | w (1) | NA | ||
| 6 (7) | B (6) | cc (1) | 0/1 | |
| dd (1) | 1c/1 | |||
| ee (3) | 1c/2 | |||
| ff (1) | 0/1 | |||
| O (1) | gg (1) | 0/1 | ||
| 7 (3) | P (1) | hh (1) | 0/1 | |
| Q (2) | ii (2) | NA | ||
| 5 | 8 (2) | A (2) | jj (2) | 2/2 |
| 9 (2) | B (1) | kk (1) | NA | |
| R (1) | ll (1) | 0/1 | ||
| 10 (3) | M (3) | mm (2) | 0/2 | |
| nn (1) | 0/1 |
a
Data for the 64 isolates in IS6110 clusters (unique isolates are not shown).
b
NA, not available.
c
Intercluster epidemiological links.