Table 2.

Association of expression of co-expressed genes in APOE ε2/ε3 AD cases (Module 1) with levels of AD-related traits and C4 subunit proteins in FHS/BUADC brains.

	Total Sample			APOE ɛ2/ɛ3			APOE ɛ3/ɛ3			APOE ɛ3/ɛ4
	β	SE	P value	β	SE	P value	β	SE	P-value	β	SE	P value
pTau231/tTau:
C4A	0.22	0.05	5.1 × 10−5	0.21	0.10	0.04	0.18	0.08	0.02	0.34	0.12	6.4 × 10−3
C4B	0.21	0.05	7.0 × 10−5	0.19	0.10	0.06	0.18	0.08	0.02	0.34	0.11	5.4 × 10−3
HSPA2	0.30	0.06	4.3 × 10−6	0.31	0.13	0.02	0.20	0.10	0.04	0.41	0.14	6.1 × 10−3
PSD95:
C4A	−0.10	0.06	0.08	−0.17	0.12	0.16	−0.06	0.09	0.51	−0.02	0.13	0.86
C4B	−0.10	0.06	0.08	−0.15	0.11	0.20	−0.05	0.08	0.55	−0.06	0.13	0.68
HSPA2	−0.10	0.07	0.17	−0.21	0.15	0.17	−0.05	0.10	0.63	−0.02	0.16	0.90
C4B:
C4A	0.06	0.05	0.33	0.14	0.13	0.29	0.01	0.09	0.90	0.19	0.14	0.19
C4B	0.05	0.05	0.43	0.14	0.13	0.26	−0.01	0.09	0.88	0.19	0.14	0.18
HSPA2	0.20	0.07	6.1 × 10−3	0.30	0.17	0.09	0.21	0.11	0.06	0.32	0.16	0.06