Table 2.

Pattern of multi-drug resistance and detected antimicrobial resistance genes in E. coli.

	Dog sample number
	Chiba								Kanagawa
	16C1	16C26	16C37	16C42	16C43	16C44	17C2	17C16	16K18	16K21	17K2	17K8	17K12	17K20	17K27	17K36	17K49	17K55
(a) Pattern of multi-drug resistance in E. coli
Antibiotic
Ampicillin	R	R	R	R	R	R		R	R	R	R	R	R	R	R		R	R
Piperacillin	I	R	R	R		R		R	R	I		I	R	R	R		R	R
Tazobactam/Piperacillin												I
Cefazolin		I		I			I	I	R	R	R	R	R	I	I	I	I	R
Cefmetazole										I
Cefotaxime									R	I	I	I
Ceftazidime										I		I				I
Cefepime
Aztreonam							I					R				R
Imipenem							R
Meropenem							I
Streptomycin	I		I		R	R		R	I	I	I	I	R	R		R	I
Kanamycin	R	R		R										R		I
Gentamicin														I
Amikacin
Tetracycline	R	R		R	R	R							R	R
Ciprofloxacin															R	I	R
Levofloxacin		I		I					R						I		R
Nalidixic acid							R		R								R
Chloramphenicol	R	R		R	R
(b) Detected antimicrobial resistance genes in E. coli
Resistance mechanism
β-lactamase	N.T	bla TEM	bla TEM	bla TEM	N.D	bla TEM	N.D	N.D	bla CTX-M-9 group CTX-M-14	bla DHA-1	N.D	N.D	bla TEM	bla TEM	bla TEM	N.D	bla TEM	bla TEM
Aminoglycoside resistance 16S rRNA methylases	N.T	N.D	N.D	N.D	N.D	N.D		N.D	N.D	N.D	N.D	N.D	N.D	N.D		N.D	N.D
Aminoglycoside modifying enzyme	N.T	N.D	N.D	N.D	N.D	N.D		N.D	N.D	N.D	N.D	N.D	N.D	N.D		N.D	N.D
Mutation of the quinolone resistance-determining regions		N.D		N.D			N.D		83S → L, 87D → Y in gyrA 80S → I in parC						N.D	N.D	83S → L, 87D → N in gyrA 80S → I in parC
Quinolone resistance protein		qnrS		qnrS			qnrB		N.D						N.D	N.D	N.D

I intermediate, R resistant, N.D. not detected, N.T. not tested.