Table 1.
List of specimens used in this study and their classification with different methods
Number | Sample number1 | Collection year2 | Host | Origin3 | Collector/source | Classification germination | HCA cluster | DAPC cluster | Classification MALDI-TOF MS | Classification morphology | Final classification |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | AA7 | 2015 | T. aestivum4 | AUT | A. E. Müllner | Cb5 | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
2 | AA8 | 2015 | T. aestivum | AUT | A. E. Müllner | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
3 | AA9 | 2015 | T. aestivum | AUT | A. E. Müllner | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
4 | AA10 | 2015 | T. aestivum | AUT | A. E. Müllner | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
5 | AA11 (CBS 144,825)6 | 2015 | T. aestivum | AUT | A. E. Müllner | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
6 | AA12 | 2015 | T. aestivum | AUT | A. E. Müllner | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
7 | AC | 2015 | T. aestivum | DEU | H. Spieß | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
8 | AD | 2014 | T. aestivum | DEU | S. Schumann | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
9 | AER | 2016 | T. aestivum | DEU | S. Weller | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
10 | AES | 2016 | T. aestivum | DEU | S. Weller | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
11 | AEZO | 2016 | T. spelta | DEU | S. Weller | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
12 | AGW | 2016 | T. aestivum | DEU | B. Schwab | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
13 | AHW | 2016 | T. aestivum | DEU | S. Weller, H. Eichinger | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
14 | AI (CBS 145,171) | 2015 | T. durum | ITA | V. Weyermann | Cb | 2 | 3 | Cb | T. laevis > T. caries7 | Cb |
15 | AKW | 2016 | T. aestivum | DEU | S. Weller | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
16 | AL | 2010 | T. aestivum | DEU | H. Mitterer | Cb | 2 | 4 | Cb | T. caries | Cb |
17 | AL14 | 2014 | T. aestivum | DEU | H. Mitterer | Cb | 2 | 4 | Cb | T. caries > T. controversa | Cb |
18 | AL15 | 2015 | T. aestivum | DEU | H. Mitterer | Cb | 2 | 4 | Cb | T. caries | Cb |
19 | AN | 2014 | T. aestivum | DEU | R. Bauer | Cb | 2 | 4 | Cb | T. caries | Cb |
20 | AN15 | 2015 | T. aestivum | DEU | R. Bauer | Cb | 2 | 4 | Cb | T. caries | Cb |
21 | AO (CBS 145,172) | 2014 | T. aestivum | DEU | R. Bauer | Cb | 2 | 4 | Cb | T. caries | Cb |
22 | AOA | 2016 | T. aestivum | DEU | B. Schwab | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries > T. controversa | Cb |
23 | ARW | 2016 | T. aestivum | DEU | S. Weller | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries > T. laevis | Cb |
24 | AS14 | 2014 | T. aestivum | DEU | B. Pölitz | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
25 | AW | 2014 | T. aestivum | DEU | R. Bauer | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries | Cb |
26 | AZH1 | 2015 | T. aestivum | CHE | V. Weyermann | Cb | 1 (b)8 | 3 | Cb | T. caries > T. laevis | Cb |
27 | AZH2 | 2015 | T. aestivum | CHE | V. Weyermann | Cb | 1 (b) | 2 | Cb | T. caries > T. laevis | Cb |
28 | AZH3 (CBS 145,166) | 2015 | T. aestivum | CHE | V. Weyermann | Cb | 1 (b) | 1 (b) | Db | T. caries > T. laevis | Cb |
29 | AZH4 | 2015 | T. aestivum | CHE | V. Weyermann | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries > T. controversa | Cb |
30 | AZH5 | 2015 | T. aestivum | CHE | V. Weyermann | Cb | 2 | 3 | Cb | T. caries > T. controversa | Cb |
31 | D-3 | -9 | T. aestivum | USA | R. J. Metzger, J. A. Hoffmann | Db10 | 1 | 4 (b) | Db | T. controversa | Db |
32 | D-4 | - | T. aestivum | USA | R. J. Metzger, J. A. Hoffmann | Db | 1 | 4 (b) | Db | T. controversa | Db |
33 | D-7 | 1999 (a) | T. aestivum | USA | R. J. Metzger, J. A. Hoffmann | Db | 1 | 1 | Db | T. caries > T. controversa | Db |
34 | D-12 | - | T. aestivum | USA | R. J. Metzger, J. A. Hoffmann | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
35 | D-13 | - | T. aestivum | USA | R. J. Metzger, J. A. Hoffmann | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
36 | D-17 | 1999 (a) | T. aestivum | USA | R. J. Metzger, J. A. Hoffmann | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
37 | D-18 | - | T. aestivum | USA | B. J. Goates, R. J. Metzger | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
38 | D-19 | - | T. aestivum | TUR | B. J. Goates, R. J. Metzger | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa > T. caries | Db |
39 | II7 | 2007 | T. spp. | IND | P. Chhuneja | NA11 | outgroup | outgroup | Kb12 | T. indica | Kb |
40 | IM5 | 2005 | T. spp. | MEX | G. Fuentes | NA | outgroup | outgroup | Kb | T. indica | Kb |
41 | L-1 | 1990 (a) | T. aestivum | - | R. J. Metzger, J. A. Hoffmann | ng13 | 0 (b) | 2 | Cb | T. laevis | Cb |
42 | L-10 | 1990 (a) | T. aestivum | - | R. J. Metzger, J. A. Hoffmann | Cb | 2 | 2 | Cb | T. laevis | Cb |
43 | L-16 | 1984 (a) | T. aestivum | - | R. J. Metzger, J. A. Hoffmann | Cb | 2 | 2 | Cb | T. laevis | Cb |
44 | L-18 | - | T. aestivum | - | R. J. Metzger | Cb | 2 | 2 | Cb | T. laevis | Cb |
45 | L-19 (CBS 145,173) | - | T. aestivum | - | R. J. Metzger | Cb | 2 | 2 | Cb | T. laevis | Cb |
46 | L-20 | - | T. aestivum | TUR | R. J. Metzger | Cb | 2 | 2 | Cb | T. laevis | Cb |
47 | L-21 | - | T. aestivum | USA | R. J. Metzger | Cb | 2 | 2 | Cb | T. laevis | Cb |
48 | OA1 | 2015 | T. aestivum | AUT | A. E. Müllner | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
49 | OA2 (CBS 145,169) | 2015 | T. aestivum | AUT | A. E. Müllner | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
50 | OA3 | 2015 | T. aestivum | AUT | A. E. Müllner | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
51 | OA4 | 2015 | T. aestivum | AUT | A. E. Müllner | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa > T. caries | Db |
52 | OA5 | 2015 | T. aestivum | AUT | A. E. Müllner | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
53 | OA6 | 2015 | T. aestivum | AUT | A. E. Müllner | Db | 1 | 1 / 4 (bc)14 | Db | T. controversa | Db |
54 | OC1 | 2015 | T. aestivum | DEU | H. Spieß | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
55 | OC2 | 2015 | T. aestivum | DEU | H. Spieß | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
56 | OL | 2013 | T. aestivum | DEU | H. Mitterer | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
57 | OL14 (CBS 145,167) | 2014 | T. aestivum | DEU | H. Mitterer | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
58 | OL16 | 2016 | T. aestivum | DEU | M. K. Forster | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
59 | OMO | 2016 | T. spelta | DEU | R. Klügl | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
60 | OR (CBS 144,827) | 2013 | T. aestivum | DEU | R. Bauer | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
61 | ORB | 2016 | T. aestivum | DEU | S. Weller | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
62 | OV (CBS 145,170) | 2011 | T. aestivum | DEU | R. Bauer | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
63 | OW15 | 2015 | T. aestivum | DEU | R. Bauer | Db | 1 | 1 | Db | T. controversa | Db |
64 | T-2 | 1989 (a) | T. aestivum | USA | R. J. Metzger, J. A. Hoffmann | Cb | 2 | 2 | Cb | T. caries | Cb |
65 | T-15 | 1978 (a) | T. aestivum | USA | R. J. Metzger, J. A. Hoffmann | Cb | 2 | 4 | Cb | T. caries | Cb |
66 | T-19 | - | T. aestivum | USA | R. J. Metzger, J. A. Hoffmann | Cb | 2 | 2 | Cb | T. caries | Cb |
67 | T-30 | - | T. aestivum | USA | R. J. Metzger, J. A. Hoffmann | Cb | 2 | 2 | Cb | T. caries > T. laevis | Cb |
68 | T-33 | - | T. aestivum | USA | R. J. Metzger | Cb | 2 | 2 | Cb | T. caries | Cb |
69 | T-34 | - | T. aestivum | USA | R. J. Metzger | Cb | 2 | 2 | Cb | T. caries > T. laevis | Cb |
1Sample numbers/collection numbers are sorted alphabetically, sample number of T. caries specimens start with A or T, T. controversa specimens starts with D or O, T. indica specimens with I, and T. laevis specimens starts with L
2(a) Year of original collection, samples constantly recultivated until 2012 by B. J. Goates
3International abbreviations used: AUT, Austria; CHE, Switzerland; DEU, Germany; IND, India; ITA, Italy; MEX, Mexico; TUR, Turkey; USA, United States of America
4T. = Triticum
5Cb, common bunt
6CBS = single teliospore culture produced and stored at strain collection of Westerdijk Fungal Biodiversity Institute, Utrecht, The Netherlands
7T. laevis > T. caries = T. laevis rather than T. caries
8(b) = false classification
9No information available
10Db, dwarf bunt
11NA, not analyzed
12Kb, karnal bunt
13ng, no germination
14(bc) = false classification (N = 67 + outgroup), true classification (N = 52 + outgroup, reference samples)