Table 1.

Campanulaceae species used in this study, including Genbank numbers for each sequenced gene/allele in each CYC gene clade

Clade	Label	Genus	Species	CYC1	CYC2B	CYC2A	CYC3
Campanuloideae	JC002(JT)	Campanula	carpatica	OM262907	OM263037		OM263196
Campanuloideae	JC008(JT)	Campanula	cochleariifolia	OM262908 OM262909
Campanuloideae	3195(NC)	Campanula	drabifolia				OM263198
Campanuloideae	JC006(JT)	Campanula	glomerata	OM262910	OM263038
Campanuloideae	CP011(JT)	Platycodon	grandiflorus	OM262918	OM263039
Campanuloideae	CJ009(JT)	Jasione	montana	OM262915
Campanuloideae	CJ001(JT)	Campanula	persicifolia	OM262911 OM262912
Campanuloideae	JC007(JT)	Campanula	portenschlagiana	OM262913 OM262914			OM263197
Campanuloideae	CP012(JT)	Phyteuma	scheuchzeri	OM262916 OM262917	OM263036
Cyphioideae	K4686	Cyphia	comptonii	OM262919			OM263203 OM263209
Cyphioideae	P5532	Cyphia	digitata	OM262920			OM263199 OM263200
Cyphioideae	K4725	Cyphia	eckloniana	OM262921			OM263207
Cyphioideae	K2340	Cyphia	lasiandra	OM262922			OM263210
Cyphioideae	K4734	Cyphia	longipetala	OM262924			OM263201 OM263204
Cyphioideae	P5461	Cyphia	rogersii	OM262925			OM263208
Cyphioideae	K4831	Cyphia	smutsii				OM263211
Cyphioideae	P5555	Cyphia	sp. nov	OM262923			OM263202 OM263205
Cyphioideae	K4726	Cyphia	volubilis	OM262926			OM263212
Cyphioideae	K4675	Cyphia	zeyheriana	OM262927			OM263206
Lobelioideae
Genistoid E	K4216	Lobelia	baumannii	OM262958	OM263140	OM263055
Genistoid E	K4942	Lobelia	comptonii	OM262965		OM263061
Genistoid E	K4773	Lobelia	dasyphylla	OM262969		OM263063
Genistoid E	K4314	Lobelia	goetzei	OM262973	OM263154	OM263066
Genistoid E	K3316	Lobelia	hartlaubii	OM262976	OM263114	OM263067
Genistoid E	K4814	Lobelia	malowensis	OM262987	OM263159	OM263070
Genistoid E	K4609	Lobelia	patula	OM262991	OM263075	OM263076
Genistoid E	P5475	Lobelia	pteropoda	OM262992		OM263079
Genistoid E	K4634	Lobelia	tomentosa	OM263010	OM263177
Genistoid E	K4654	Lobelia	vanreenensis	OM263014		OM263094
Impares F	K5251	Lobelia	cleistogamoides	OM262962 OM262963			OM263215
Impares F	K5245A	Lobelia	heterophylla	OM262964			OM263213 OM263214
Impares F	K5210	Colensoa	physaloides	OM262935 OM262936			OM263218
Impares F	K5242	Lobelia	rarifolia	OM262994 OM262995		OM263080
Impares F	K5259	Lobelia	rhombifolia	OM262996 OM262997		OM263081
Impares F	K5253	Lobelia	rhytidosperma	OM262998		OM263084
Impares F	K5279	Lobelia	simplicicaulis	OM263000 OM263002	OM263172	OM263087
Impares F	K5234	Lobelia	tenuior	OM263007			OM263216
Impares F	A10185	Lobelia	trigonocaulis	OM263011		OM263091	OM263217
Impares F	K5252	Lobelia	winifrediae		OM263082	OM263083
Monopsis G	K4628	Monopsis	alba	OM263023	OM263108	OM263107
Monopsis G	K4790	Monopsis	debilis	OM263025
Monopsis G	K4646	Monopsis	decipiens	OM263024		OM263104
Monopsis G	K5116	Monopsis	flava	OM263026
Monopsis G	K4402	Monopsis	stellarioides	OM263027	OM263109
Monopsis G	P5246	Monopsis	unidentata	OM263028		OM263105 OM263106
Broom H	P5621	Lobelia	lasiantha	OM262978
Broom H	K4599	Lobelia	linearis	OM262980
Grammatotheca I	K4642	Lobelia	thermalis			OM263089
Erinoid L	K4951	Lobelia	boivinii			OM263057
Erinoid L	K3475	Lobelia	cymbalarioides	OM262968		OM263062
Erinoid L	JL002(JT)	Lobelia	erinus	OM262970	OM263152	OM263065
Erinoid L	K4964	Lobelia	inconspicua			OM263068
Erinoid L	K3401	Lobelia	minutula	OM262988		OM263073
Erinoid L	K4841	Lobelia	wilmsiana	OM263017		OM263090
Wimmerella M	K5276	Lobelia	anceps		OM263137
Wimmerella M	K4685	Wimmerella	bifida	OM263035	OM263192
Wimmerella M	K4594	Wimmerella	hederacea	OM263033	OM263193	OM263097
Wimmerella M	K4545	Wimmerella	pygmaea	OM263034	OM263194	OM263101
Wimmerella M	K5104	Wimmerella	secunda		OM263195	OM263102
Mezlerioid3 N	K5182	Lobelia	jasionoides	OM262977	OM263155
Mezlerioid3 N	K4566	Lobelia	laurentioides	OM262979	OM263157
Mezlerioid3 N	K4589	Lobelia	muscoides	OM262989	OM263161
Solenopsis O	Gr04/1	Lobelia	urens		OM263180	OM263092
W North America P	K4663	Downingia	bicornuta	OM262948
W North America P	UCBG770105	Palmerella	debilis	OM262946		OM263098
W North America P	K4667	Porterella	carnosula	OM262947	OM263115	OM263099
Diastatea Q	Wo8295	Diastatea	micrantha		OM263110 OM263111	OM263050
E North America R	Jl007(JT)	Lobelia	cardinalis		OM263146	OM263060
E North America R	K5282	Lobelia	dortmanna		OM263151
E North America R	K2408	Lobelia	fenestralis	OM262949	OM263112
E North America R	K5092	Lobelia	puberula		OM263113
E North America R	JL003(JT)	Lobelia	siphilitica		OM263173	OM263088
South America S	Ra s.n.2	Burmeistera	crispiloba	OM262930 OM262931		OM263042
South America S	Lu15078	Centropogon	comosus	OM262932 OM262933	OM263119	OM263043
South America S	JL005(JT)	Lobelia	bridgesii	OM262960 OM262961	OM263143	OM263058
South America S	JL006(JT)	Lobelia	polyphylla		OM263164 OM263165	OM263078
South America S	JL004(JT)	Lobelia	tupa	OM263012 OM263013	OM263178 OM263179
Australasia T	RBGK2368	Hypsela	Reniformis	OM262942	OM263129
Australasia T	A9820	Isotoma	gulliveri	OM262944 OM262945	OM263132
Australasia T	K5237	Isotoma	hypocrateriformis	OM262943	OM263133	OM263134
Australasia T	LI010(JT)	Lithotoma	axillaris		OM263130	OM263051
Australasia T	W5440	Lithotoma	petraea	OM262954	OM263131	OM263052
Australasia T	K5024A	Lobelia	macrodon	OM262985	OM263072	OM263071
Australasia T	Ck2245	Lobelia	pratioides	OM262993	OM263166	OM263077
Australasia T	K5027	Lobelia	roughii	OM262999	OM263167	OM263085
Australasia T	K2369	Pratia	arenaria	OM262950 OM262951	OM263187
Australasia T	W5265	Pratia	gelida	OM262952	OM263188
Australasia T	A5357	Pratia	pedunculata	OM262953	OM263189	OM263100
Giants U	NTBG970260	Apetahia	longistigmata	OM262928 OM262929	OM263116 OM263117
Giants U	4561(CM)	Brighamia	insignis	OM262905 OM262906	OM263118	OM263040 OM263041
Giants U	6799(CM)	Clermontia	micrantha		OM263120	OM263044
Giants U	7011 (CM)	Clermontia	persicifolia	OM262934	OM263121	OM263045
Giants U	1754(CM)	Cyanea	acuminata	OM262937 OM262938	OM263122	OM263046
Giants U	K2375	Cyanea	leptostegia	OM262939 OM262940
Giants U	2452(CM)	Cyanea	superba	OM262941	OM263123 OM263124
Giants U	5416(CM)	Delissea	rhytidosperma	OM262896 OM262897 OM262903 OM262904	OM263125 OM263126	OM263047 OM263048
Giants U	3835(CM)	Delissea	subcordata	OM262901 OM262902	OM263127 OM263128	OM263049
Giants U	K706	Lobelia	aberdarica	OM262955 OM262956	OM263135 OM263136	OM263053
Giants U	K731	Lobelia	bambuseti		OM263138 OM263139	OM263054
Giants U	K220	Lobelia	bequaertii	OM262957 OM262959	OM263141 OM263142	OM263056
Giants U	K802	Lobelia	burttii		OM263144 OM263145	OM263059
Giants U	M2085	Lobelia	columnaris	OM262966 OM262967	OM263147 OM263148
Giants U	K2353	Lobelia	doniana	OM262900	OM263149 OM263150	OM263064
Giants U	K118	Lobelia	giberroa	OM262971 OM262972	OM263153
Giants U	K698	Lobelia	gregoriana	OM262974 OM262975
Giants U	K2381	Lobelia	kauaensis	OM262898 OM262899	OM263156
Giants U	K3522	Lobelia	longisepala	OM262981		OM263069 OM263096
Giants U	K623	Lobelia	lukwangulensis	OM262982 OM262983 OM262984	OM263158	OM263093
Giants U	K426	Lobelia	mildbraedii		OM263160
Giants U	K619	Lobelia	morogoroensis	OM262986		OM263074
Giants U	NTBG910521	Lobelia	niihauensis	OM262990	OM263162
Giants U	7162(CM)	Lobelia	oahuensis		OM263163
Giants U	K610	Lobelia	sancta	OM263001	OM263168 OM263169	OM263086
Giants U	RBGK5627	Lobelia	sessilifolia		OM263170 OM263171
Giants U	K120	Lobelia	stuhlmannii	OM263003 OM263004	OM263174
Giants U	K689	Lobelia	telekii	OM263005 OM263006
Giants U	K876	Lobelia	thuliniana	OM263008 OM263009	OM263175 OM263176
Giants U	4097(CM)	Lobelia	villosa	OM263015 OM263015 OM263022	OM263181 OM263182	OM263095
Giants U	K262	Lobelia	wollastonii	OM263018 OM263019	OM263183 OM263184
Giants U	K2379	Lobelia	yuccoides	OM263020 OM263021	OM263185 OM263186
Giants U	4887(CM)	Trematolobelia	kauaiensis	OM263029 OM263031
Giants U	4764(CM)	Trematolobelia	macrostachys	OM263030 OM263032	OM263190 OM263191	OM263103

Included a total of 132 DNA samples, from 128 species, including 9 Cyphioideae species, 9 Campanuloideae species, and 110 Lobelioideae species

(JT = Jingjing Tong, NC = Nico Cellinese, CM = Clifford Morden, all other samples provided by Eric Knox) [75, 76]