TABLE 4.
Algorithm for PRA of the hsp65 gene
| Pattern with Sau96I | Pattern with CfoI | Species |
|---|---|---|
| A | g | M. simiae, M. habana |
| B | g | M. scrofulaceuma |
| h | M. avium | |
| i | M. intracellure | |
| C | g | M. marinum |
| h | M. mucogenicum | |
| j | M. pulveris | |
| D | h | M. genavense |
| E | b | M. kansasii type I and II, M. gastri |
| g | M. asiaticum, M. kansasii type III, M. gordonae, M. scrofulaceum type B | |
| F | b | M. kansasii type IV |
| g | M. gordonae, M. terrae, M. scrofulaceumb | |
| G | a | M. neoaurum |
| c | M. fortuitum, M. senegalense | |
| d | M. tuberculosis complex | |
| e | M. shimoidi | |
| f | M. abscessus | |
| g | M. scrofulaceum,b M. kansasii type VI, M. ulcerans, M. szulgai, M. marinum, M. flavescens, M. malmoense, M. chitae | |
| h | M. fortuitum, M. smegmatis, M. nonchromogenicum, M. phlei, M. fallax, M. perigenicum, M. brumae | |
| H | c | M. rhodesiae |
| f | M. abscessus | |
| g | M. gordonae, M. scrofulaceum,b M. xenopi, M. agri | |
| h | M. vaccae, M. aurum, M. confluentis | |
| i | M. chelonae |