TABLE 1.
Determination of clarithromycin susceptibility of 109 clinical H. pylori isolates by FISH, disk diffusion, and E-test
No. of H. pylori isolates | Result by:
|
||||||
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FISHa
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Disk diffusionb | E-testc | |||||
Hpy-1 | ClaWT | ClaR1 | ClaR2 | ClaR3 | |||
4 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 64 | 0.016 |
1 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 62 | 0.016 |
16 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 60 | 0.016 |
6 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 58 | 0.016 |
7 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 56 | 0.016 |
5 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 54 | 0.016 |
11 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 52 | 0.016 |
6 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 50 | 0.016 |
5 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 48 | 0.016 |
1 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 46 | 0.016 |
1 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 50 | 0.023 |
1 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 46 | 0.023 |
1 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 56 | 0.032 |
1 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 54 | 0.032 |
1 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 52 | 0.032 |
1 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 50 | 0.032 |
1 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 48 | 0.032 |
1 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 46 | 0.032 |
2 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 50 | 0.047 |
2 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 48 | 0.047 |
1 | Pos. | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | 44 | 0.094 |
12 | Pos. | Neg. | Pos. | Neg. | Neg. | 0 | >256 |
4 | Pos. | Neg. | Neg. | Pos. | Neg. | 0 | 16 |
1 | Pos. | Neg. | Neg. | Pos. | Neg. | 0 | 24 |
2 | Pos. | Neg. | Neg. | Pos. | Neg. | 0 | 32 |
2 | Pos. | Neg. | Neg. | Pos. | Neg. | 0 | 64 |
11 | Pos. | Neg. | Neg. | Pos. | Neg. | 0 | >256 |
2 | Pos. | Neg. | Neg. | Neg. | Pos. | 0 | >256 |
Probe Hpy-1 specifically identifies H. pylori. Probe ClaWT identifies clarithromycin-sensitive strains, whereas probes ClaR1 (A2143G), ClaR2 (A2144G), and ClaR3 (A2143C) identify point mutations responsible for clarithromycin resistance. Pos., positive; Neg., negative.
Values are clarithromycin zone diameters (in millimeters).
Values are clarithromycin MICs (in micrograms per milliliter).