TABLE 2.
Correlation analysis between genotypes and alleles of selected SNPs and susceptibility of MJD.
Study group | variables | ||||||||||||||||||||
Genotypic distribution
|
Genotypic distribution (dominant model)
|
Genotypic distribution (recessive model)
|
Allelic frequency
|
||||||||||||||||||
rs2234759 |
AA
|
AG
|
GG
|
AA
|
AG + GG
|
AA + AG
|
GG
|
A
|
G
|
||||||||||||
N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | ||||
| |||||||||||||||||||||
MJD (N = 300) | 79 | 26.33 | 149 | 49.67 | 72 | 24 | 79 | 26.33 | 221 | 73.67 | 228 | 76 | 72 | 24 | 307 | 51.17 | 293 | 48.83 | |||
Control (N = 300) | 71 | 23.67 | 155 | 51.67 | 74 | 24.66 | 71 | 23.67 | 229 | 76.33 | 226 | 75.33 | 74 | 24.67 | 297 | 49.5 | 303 | 50.5 | |||
P value (χ2) | 0.751 (0.572) | 0.451 (0.569) | 0.849 (0.036) | 0.564 (0.333) | |||||||||||||||||
OR (95%CI) | – | 1.153 (0.796–1.669) | 1.037 (0.714–1.506) | 1.069 (0.852–1.340) | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||
rs3037354 |
TG
|
TG.DEL
|
DEL
|
TG
|
TG.DEL + DEL
|
TG + TG.DEL
|
DEL
|
TG
|
DEL
|
||||||||||||
N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | ||||
| |||||||||||||||||||||
MJD (N = 300) | 135 | 45 | 138 | 46 | 27 | 9 | 135 | 45 | 165 | 55 | 273 | 91 | 27 | 9 | 408 | 68 | 192 | 32 | |||
Control (N = 300) | 134 | 44.67 | 125 | 41.67 | 41 | 13.66 | 134 | 44.67 | 166 | 55.33 | 259 | 86.33 | 41 | 13.67 | 393 | 65.5 | 207 | 34.5 | |||
P value (χ2) | 0.171 (3.529) | 0.935 (0.007) | 0.071 (3.251) | 0.358 (0.845) | |||||||||||||||||
OR (95%CI) | – | 1.014 (0.735–1.398) | 1.601 (0.957–2.678) | 1.119 (0.880–1.423) | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||
rs11100494 |
CC
|
CA
|
AA
|
CC
|
CA + AA
|
CC + CA
|
AA
|
C
|
A
|
||||||||||||
N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | ||||
| |||||||||||||||||||||
MJD (N = 300) | 235 | 78.33 | 60 | 20 | 5 | 1.67 | 235 | 78.33 | 65 | 21.67 | 295 | 98.33 | 5 | 1.67 | 530 | 88.33 | 70 | 11.67 | |||
Control (N = 300) | 214 | 71.33 | 75 | 25 | 11 | 3.67 | 214 | 71.33 | 86 | 28.67 | 289 | 96.33 | 11 | 3.67 | 503 | 83.83 | 97 | 16.17 | |||
P value (χ2) | 0.086 (4.899) | 0.048 (3.903) | 0.128 (2.312) | 0.024 (5.071) | |||||||||||||||||
OR (95%CI) | 1.453 (1.002–2.107) | 2.246 (0.771–6.544) | 1.460 (1.049–2.032) | ||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||
N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | N | % | ||||
| |||||||||||||||||||||
MJD (N = 527) | 393 | 74.57 | 125 | 23.72 | 9 | 1.71 | 393 | 74.57 | 134 | 25.43 | 518 | 98.29 | 9 | 1.71 | 911 | 143 | |||||
Control (N = 487) | 334 | 68.58 | 136 | 27.93 | 17 | 3.49 | 334 | 68.58 | 86 | 31.42 | 470 | 96.51 | 17 | 3.49 | 804 | 170 | |||||
P value (χ2) | 0.046 (6.145) | 0.034 (4.475) | 0.073 (3.221) | 0.016 (5.858) | |||||||||||||||||
OR (95%CI) | – | 1.343 (1.022–1.767) | 2.082 (0.919–4.715) | 1.347 (1.058–1.715) |