Table 2.

Proxies (LD r² > 0.9) for MHC region index variants.

Phenotype	Index variant	Proxies
		Residues^	Haplotypes
ADA positive	AA_DRB1_120_32657518_N	DRB1_96, DRB1_112, DRB1_166, DRB1_180	HLA_DRB1_0407
	AA_DQB1_75_32740612*	DQB1_66, DQB1_67, DQB1_71, DQB1_74	N/A
	rs3093664	N/A	N/A
ADA max titer	rs7756741	DRB1_9, DRB1_11, DRB1_13	N/A
	rs3763313	N/A	N/A
ADA max titer top 10%	AA_DQB1_71_32740624_KD*	DQB1_66, DQB1_67, DQB1_74, DQB1_75	N/A

*Same LD cluster. ^Residues affected by non-synonymous proxies.