TABLE 2.

3-mer sparse matrix of protein sequence.

	p 1 p 2 p 3	p 2 p 3 p 4	…	p n-2 p n-1 p n
‘AGV’ ‘AGV’ ‘AGV’	a11	a12	…	a1,n-2
‘AGV’ ‘AGV’ ‘TMTS’	a21	a22	…	a2,n-2
‘AGV’ ‘TMTS’ ‘AGV’	a31	a32	…	a3,n-2
…	…	…	…	…
‘C’ ‘C’ ‘C’	a343,1	a343,2	…	a343,n-2