TABLE 2.
CRISPR group | CRISPR spacers (CRR1 : CRR2) |
|||||||
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Plasmid origin |
Phage origin |
|||||||
pEU30 | Erwinia spp. | Other | Total | ΦEt88 | Erwinia spp. | Other | Total | |
Amygdaloideae-infecting | 40 : 16 | 4 : 3 | 11 : 3 | 55 : 22 | 3 : 0 | 0 : 0 | 2 : 0 | 5 : 0 |
Group I & II | 2 : 0 | 1 : 3 | 5 : 3 | 8 : 6 | 2 : 0 | 0 : 0 | 0 : 0 | 2 : 0 |
Group III | 31 : 6 | 3 : 2 | 9 : 3 | 43 : 11 | 3 : 0 | 0 : 0 | 2 : 0 | 5 : 0 |
Group IV | 32 : 15 | 2 : 2 | 7 : 3 | 41 : 20 | 1 : 0 | 0 : 0 | 2 : 0 | 3 : 0 |
B-Group | 3 : 11 | 8 : 12 | 14 : 9 | 25 : 32 | 3 : 3 | 1 : 1 | 3 : 0 | 7 : 4 |
Rubus-infecting | 3 : 1 | 14 : 10 | 4 : 9 | 21 : 20 | 19 : 9 | 1 : 1 | 5 : 7 | 25 : 17 |
Rubus I | 1 : 1 | 3 : 2 | 4 : 2 | 8 : 5 | 9 : 3 | 0 : 1 | 6 : 5 | 15 : 8 |
Rubus II | 2 : 0 | 10 : 7 | 1 : 3 | 13 : 10 | 10 : 5 | 1 : 0 | 6 : 1 | 17 : 6 |
Rubus III | 3 : 1 | 14 : 10 | 4 : 9 | 21 : 20 | 19 : 9 | 1 : 1 | 5 : 7 | 25 : 17 |
E. amylovora | 43 : 23 | 24 : 14 | 31 : 21 | 98 : 68 | 27 : 16 | 4 : 3 | 24 : 9 | 55 : 28 |