TABLE 4.
Nucleotide mutations and amino acid substitutions in blaTEM-like genes and new IRT-encoding genes in comparison with blaTEM-1A, blaTEM-1B, blaTEM-1C, and blaTEM-2 genes
| Strain | blaTEM | Mutation (substitution) at nucleotide position (amino acid codon)
|
Reference | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 32 | 141 (−35) | 162 (−10) | 175 | 226 (6) | 317 (39) | 346 (48) | 407 (69) | 436 (78) | 581 (127) | 590 (130) | 604 (134) | 682 (160) | 695 (165) | 697 (165) | 913 (237) | 925 (242) | 929 (244) | 1020 (275) | 1022 (276) | |||
| 1A | C | C | G | A | C | C (Gln) | A | A (Met) | C | A (Ile) | A (Ser) | G | T | T (Trp) | G (Trp) | C | G | C (Arg) | G (Arg) | A (Asn) | 36 | |
| 1B | G | T | T | T | 18a | |||||||||||||||||
| 1C | T | 18 | ||||||||||||||||||||
| 2 | T | A (Lys) | G | T | C | A | 18a | |||||||||||||||
| 602042 | 1B-like | T | G | T | T | T | ||||||||||||||||
| 714028 | 1B-like | T | G | T | T | T | ||||||||||||||||
| 805009 | 1B-like | G | G | T | T | T | ||||||||||||||||
| 710020 | 1D | T | T | |||||||||||||||||||
| 801148 | 1E | G | T | G | T | T | ||||||||||||||||
| 606160 | 1F | T | G | T | C | A | ||||||||||||||||
| 609046 | 84 | T | G | T | A | G (Asp) | ||||||||||||||||
| 614078 | 84 | T | G | T | A | G (Asp) | ||||||||||||||||
| 811020 | 76 | G | T | T | G (Gly) | T | ||||||||||||||||
| 803013 | 79 | G | T | T | G (Gly) | |||||||||||||||||
| 801009 | 77 | G | T | C (Leu) | T | T | A (Ser) | |||||||||||||||
| 601105 | 81 | T | C (Leu) | G (Val) | ||||||||||||||||||
| 614024 | 82 | T | G (Val) | A (Gln) | ||||||||||||||||||
| 801155 | 78 | T | G | G (Val) | T | C | C (Arg) | A | G (Asp) | |||||||||||||
| 813147 | 83 | T | G | T (Ile) | T | C | T (Cys) | A | A (Gln) | |||||||||||||