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. 2022 Jan 20;9:uhab086. doi: 10.1093/hr/uhab086

Table 4.

The ten most likely potential off-target sites identified using Cas-OFFinder

sgRNA ID Sequence
Melon-sgRNA OT1 TTCTaTcCTACCGTTGaTGAGG
OT2 TTCTGTcCcACaGTTGGTGAGG
OT3 TTCTGccCcACaGTTGGTGAGG
OT4 TTtTGTGCTcCCtTTtGTGGGG
OT5 cTCTtTGCTtCtGTTGGTGTGG
OT6 gTCTGTcCTAtaGTTGGTGAGG
OT7 TTCTGTctcACaGTTGGTGAGG
OT8 TTtTGTGCgACatTTGGTGTGG
OT9 TTaTGTGCTtaCtTTGGTGGGG
OT10 TTaTtctCTACCGTTGGTGAGG
Cucmber-sgRNA OT1 TTtTGTGCTtggGTTGGTGTGG
OT2 cTCTtTGCTtCtGTTGGTGTGG
OT3 TTCTaTGaTAtCGTaGGTGTGG
OT4 TTCTGTGtTAaacTTGGTGTGG
OT5 ggtTGTGCTACCGgTGGTGTGG
OT6 TTCTcTaCaACtGTTGGTGTGG
OT7 TTgTGTGtTAtCGTTGcTGTGG
OT8 TTCTtTtCTACgaTTGGTGCGG
OT9 TTtTGTGCTtCaGgTGGTGGGG
OT10 TTCaGTGCaACaaTTGGTGTGG
Squash-sgRNA OT1 cACAGTtACCAATCTCATCAGG
OT2 cACAGTtACCAATCTCATCAGG
OT3 AACAGcCACCAATaTCcTCAGG
OT4 AACAGaCttCAATtTCATCAGG
OT5 AACAGTtcCCAATacCATCAGG
OT6 AAaAtctACCAATCTCATCCGG
OT7 AAaAGTaACCgcTCTCATCTGG
OT8 AACAtcCtCCAATtTCATCAGG
OT9 AACAGcCACaAtTCaCATCTGG
OT10 AACAaTaAtCcATCTCATCAGG

Lowercase letters represent mismatches with sgRNA.