TABLE 1.
Epidemiology, phenotypes, and β-lactamase genes of K. pneumoniae isolates collected in 1994 and 1996
Isolate (yr collected) | Date collected (day/mo) | Ward | Source | Etest MIC ratioa | PFGE type | Plasmid size (kb) | β-Lactamase(s)
|
||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Gene hybridizationb | pI value(s) | Sequence(s) found | |||||||
79 (1994) | 04/10 | ICU | Central venous catheter | 16 | A | 140 | 1 × TEM | 5.6 | TEM-63 |
87 | 1 × SHV | 6.3 | |||||||
7.6 | SHV-19 | ||||||||
113 (1994) | No data | No data | Blood | >32 | A | 136 | 2 × TEM | TEM-53 | |
103 | 1 × SHV | 5.6 | |||||||
80 | 7.6 | SHV-19 | |||||||
63 | |||||||||
114 (1994) | No data | No data | Blood | >32 | A | 136 | 2 × TEM | TEM-53 | |
103 | 1 × SHV | 5.6 | |||||||
80 | 7.6 | SHV-19 | |||||||
63 | |||||||||
122c (1994) | 09/10 | ICU | Central venous catheter | <2 | A | 142 | 1 × TEM | 5.4 | TEM-1 |
111 | 1 × SHV | 7.6 | SHV-19 | ||||||
88 | |||||||||
72 | |||||||||
7 | |||||||||
202c (1994) | 12/10 | ICU | Peritoneal fluid | >32 | A1 | 186 | 1 × TEM | 5.6 | TEM-63 |
111 | 1 × SHV | 7.6 | SHV-19 | ||||||
10 (1994) | 27/09 | Surgical | Pus | >32 | A1 | 140 | 2 × TEM | 5.6 | TEM-63 |
41 | 1 × SHV | 6.3 | |||||||
7.6 | SHV-19 | ||||||||
73 (1994) | 02/10 | Orthopedic | Pus | 8 | A2 | 140 | 1 × TEM | 5.6 | TEM-53 |
41 | 1 × SHV | 6.3 | |||||||
7.6 | SHV-19 | ||||||||
91 (1994) | No data | No data | Blood culture | >32 | A3 | 136 | 1 × TEM | 5.6 | TEM-63 |
103 | 1 × SHV | 7.6 | SHV-19 | ||||||
35 | |||||||||
117c (1994) | 05/10 | ICU | Pus (abdomen) | <2 | A3 | 103 | 1 × TEM | TEM-53 | |
80 | 1 × SHV | 7.6 | SHV-19 | ||||||
63 | |||||||||
35 | |||||||||
30 | |||||||||
118c (1994) | 05/10 | ICU | Pus (abdomen) | <2 | C | 136 | 1 × TEM | TEM-53 | |
103 | 1 × SHV | 7.6 | SHV-19 | ||||||
80 | |||||||||
63 | |||||||||
97 (1994) | No data | No data | Blood | <2 | B | 136 | 2 × TEM | TEM-1 | |
103 | 1 × SHV | 7.6 | SHV-19 | ||||||
571 (1994) | No data | No data | Blood | 8 | D | 140 | 1 × TEM | 5.4 | TEM-1 |
87 | 2 × SHV | 5.6 | |||||||
71 | 6.3 | ||||||||
59 | 6.8 | ||||||||
49 | 7.6 | SHV-2 and -21 | |||||||
41 | |||||||||
35 | |||||||||
4291e (1996) | 28/06 | ICU | Endotracheal aspirate | 64 | A | 139 | 3 × TEM | TEM-53 | |
88 | 2 × SHV | 5.4 | |||||||
50 | 5.6 | ||||||||
6.3 | |||||||||
6.8 | |||||||||
7.6 | SHV-1 and -2 | ||||||||
4495 (1996) | 08/07 | ICU | Endotracheal aspirate | >128 | A4 | 139 | 3 × TEM | 5.4 | TEM-1 (2)f |
110 | 2 × SHV | 5.6 | |||||||
59 | 7.6 | SHV-1 | |||||||
8.2 | SHV-5 | ||||||||
4265d (1996) | 27/06 | ICU | Endotracheal aspirate | >128 | E | 142 | 2 × TEM | 5.4 | TEM-1 (2) |
2 × SHV | 5.6 | ||||||||
6.3 | |||||||||
7.6 | SHV-1 | ||||||||
8.2 | SHV-5 | ||||||||
4744d (1996) | 18/07 | Nursery | Sputum | >128 | E | 142 | 2 × TEM | 5.4 | TEM-1 (2) |
2 × SHV | 6.3 | ||||||||
7.6 | |||||||||
8.2 | SHV-5 (2) | ||||||||
8143d (1996) | 29/06 | ICU | Blood | >128 | E | 142 | 2 × TEM | 5.4 | TEM-1 (2) |
2 × SHV | 5.6 | ||||||||
7.6 | |||||||||
8.2 | SHV-5 and -22 | ||||||||
4120 (1996) | 20/06 | ICU | Endotracheal aspirate | 32 | F | 87 | 2 × TEM | 5.4 | TEM-1 (2) |
71 | 2 × SHV | 6.3 | |||||||
59 | 6.8 | ||||||||
7.6 | SHV-2 (2) | ||||||||
4448 (1996) | 05/07 | Nursery | Pus (drip site) | 64 | F1 | 139 | 3 × TEM | TEM-53 | |
110 | 2 × SHV | 5.4 | |||||||
59 | 5.6 | ||||||||
50 | 7.6 | SHV-19 | |||||||
8.2 | SHV-5 | ||||||||
4175e (1996) | 22/06 | ICU | Endotracheal aspirate | 4 | G | 140 | 1 × TEM | 5.4 | TEM-1 |
87 | 2 × SHV | 6.3 | |||||||
7 | 6.8 | ||||||||
5 | 7.6 | SHV-1 (2) | |||||||
4183d (1996) | 22/06 | ICU | Endotracheal aspirate | >128 | H | 139 | 1 × TEM | 5.4 | TEM-1 |
110 | 2 × SHV | 5.6 | |||||||
50 | 6.3 | ||||||||
7.6 | SHV-20 | ||||||||
8.2 | SHV-5 | ||||||||
4634 (1996) | No data | No data | No data | >64 | I | 139 | 3 × TEM | 5.4 | TEM-1 |
110 | 2 × SHV | 6.8 | |||||||
50 | 7.6 | SHV-2 (2) | |||||||
23 | 8.2 | ||||||||
4669 (1996) | 17/07 | Nursery | Pleural cavity tap | >32 | J | 139 | 3 × TEM | 5.4 | TEM-1 (3) |
110 | 2 × SHV | 6.3 | |||||||
72 | 7.6 | SHV-2 and -20 | |||||||
59 | 8.2 | ||||||||
4700 (1996) | 17/07 | Pediatric | Urine | >64 | K | 186 | 2 × TEM | 5.4 | |
111 | 2 × SHV | 5.6 | TEM-63 (2) | ||||||
6.3 | |||||||||
7.6 | SHV-1 (2) | ||||||||
4824 (1996) | 22/07 | ICU | Endotracheal aspirate | 8 | L | 142 | 2 × TEM | 5.4 | TEM-1 (2) |
59 | 2 × SHV | 7.6 | SHV-1 and -20 | ||||||
7 |
Ratio of MIC of ceftazidime to the MIC of ceftazidime plus clavulanate at 4 μg/ml, as determined by the Etest.
Numbers of SHV genes were estimated from Southern blots of whole genomic DNA digested with SalI and hybridized with a SHV-specific probe, and the numbers of TEM genes were estimated from Southern blots of whole genomic DNA digested with BamHI, HindIII, or HincII and hybridized with a TEM-specific probe.
Four isolates from patient I.
Four isolates from patient II.
Two isolates from patient III.
Numbers in parentheses indicate the number of copies of the gene encoding the β-lactamase indicated.