Table 1.

List of primer used in RT-qPCR.

Target RNA	Primer Name	Primer Sequence
FL HIV-1 RNA	sHIV-1306	5′-TCAGCATTATCAGAAGGAGCCACC-3′
	aHIV-1541	5′-TCATCCATCCTATTTGTTCCTGAAG-3′
MS HIV-1 RNA	sHIV-5967	5′-CTATGGCAGGAAGAAGCGGAG-3′
	aHIV-8527	5′-CAAGCGGTGGTAGCTGAAGAG-3′
HIV-1 env RNA	sHIV-729SD1A5	5′-GAGGGGCGGCGACTGGAAGAA-5′
	aHIV-6134	5′-ACTATGGACCACACAACTATTGC-5′
GAPDH	GA-721	5′-GCTCACTGGCATGGCCTTCCGTGT-5′
	GA-931	5′ TGGAGGAGTGGGTGTCGCTGTTGA-5′
7SL	s7S-22	5′-CTGTAGTCCCAGCTACTCG-5′
	a7S-148	5′-CCCGGGAGGTCACCATATT-5′
U6	sU6-3	5′-GCTCGCTTCGGCAGCACATATACT-5′
	aU6-103	5′-TATGGAACGCTTCACGAATTTGCG-5′