Table 3. Effects of SARS-CoV-2 mutations on presentability of peptides.
↓, loss of presentation; ↑, higher presentation; ⟵, shift in presentation landscape.
| Strain | Mutation | DRB1*04:04 | DRB1*04:01 | DRB1*08:03 |
DPA1*02:02/ DPB1*05:01 |
DRB1*11:01 | DRB1*14:05 | DRB1*15:01 | DRB1*07:01 |
| B.1.1.7 | |||||||||
| D3L | ↑ | ||||||||
| S235F | ↓ | ↓ | |||||||
| T1001I | |||||||||
| A1708D | ↓ | ||||||||
| I2230T | ↓ | ||||||||
| SGF del | ↓ | ||||||||
| Y73C | ↓ | ↓ | ↓ | ↓ | ↓ | ↓ | |||
| HV69 del | ↓ | ||||||||
| Y144 del | |||||||||
| A570D | ↑ | ||||||||
| P681H | |||||||||
| T716I | ⟵↑ | ||||||||
| S982A | |||||||||
| D1118H | ⟵↑ | ↑ | ↑ | ↑ | ↑ | ||||
| B.1.1.7/351 | N501Y | ||||||||
| B.1.351 | |||||||||
| L18F | |||||||||
| D80A | |||||||||
| D215G | |||||||||
| 242-244del | ↓ | ||||||||
| R246I | ↓ | ↓ | ↓ | ↓ | ↓ | ||||
| K417T | |||||||||
| B.1.351/526 | E484K | ||||||||
| B.1.526 | A701V | ||||||||
| B.1.526 | D614G | ||||||||
| B.1.298 | Y453F |