表 3 雷公藤核心毒性化合物与核心卵巢毒性靶点基因分子对接的CDOCKER相互作用能
Table 3 The CDOCKER interaction energy between core toxic compounds and hub ovarian toxicity target genes of Tripterygium wilfordii Hook.F.in molecular docking
|
毒性靶点基因 |
PDB ID |
RMSD （×10 –10 m） |
CDOCKER相互作用能 （kJ/mol） |
|||
|
雷公藤甲素 |
山柰酚 |
雷公藤红素 |
原配体 |
|||
|
TP53 |
5HMH |
0.474937 |
137.2 |
267.1 |
298.6 |
309.1 |
|
MYC |
6U80 |
0.280991 |
157.4 |
228.3 |
263.3 |
184.0 |
|
PTEN |
4C4F |
0.213419 |
134.5 |
236.2 |
212.9 |
170.7 |
|
MAPK3 |
4QTB |
1.212460 |
182.1 |
283.5 |
193.3 |
360.9 |
|
MTOR |
4HVB |
0.753273 |
166.4 |
302.6 |
263.9 |
245.6 |
|
STAT3 |
5E1E |
0.754705 |
204.2 |
205.9 |
194.7 |
216.0 |
|
EGFR |
5D41 |
0.458168 |
94.1 |
239.0 |
183.8 |
223.4 |
|
KRAS |
6GJ5 |
0.646935 |
145.8 |
144.5 |
164.9 |
156.4 |
|
CDH1 |
3FF8 |
— |
125.8 |
239.3 |
197.3 |
— |
|
AKT1 |
3OS5 |
0.945302 |
172.6 |
191.1 |
183.9 |
207.6 |
“—”：靶点基因蛋白晶体结构中无配体. PDBID：蛋白结构数据库编号；RMSD：均方根偏差.