Skip to main content
. 2022 May 11;13:825685. doi: 10.3389/fgene.2022.825685

TABLE 2.

Correlation between FANCD2 levels and markers of immune cells based on TIMER and GEPIA databases.

Cell type Gene marker None Purity Tumor Normal
Cor P Cor P R P R P
B cell CD19 −0.003 0.9410 0.004 0.9210 −0.085 0.063 0.41 0.0011**
CD20(KRT20) 0.027 0.5440 0.021 0.6440 0.071 0.12 −0.039 0.77
CD38 0.049 0.2720 0.064 0.1560 −0.0043 0.92 0.14 0.29
CD8+ T cell CD8A 0.201 *** 0.231 *** 0.078 0.085 0.11 0.41
CD8B 0.192 *** 0.202 *** 0.12 0.0082** 0.085 0.52
BCL6 0.019 0.6600 0.024 0.5960 0.056 0.22 0.13 0.31
ICOS 0.162 0.0002*** 0.202 *** 0.069 0.13 0.32 0.014**
CXCR5 −0.013 0.7760 −0.005 0.9150 −0.098 0.032 0.4 0.0017**
Th1 T-bet (TBX21) 0.156 0.0004*** 0.184 *** 0.035 0.44 −0.033 0.8
STAT4 0.081 0.0646 0.098 0.0291 0.033 0.47 0.31 0.18
IL12RB2 0.457 *** 0.483 *** 0.22 *** 0.14 0.29
WSX1(IL27RA) −0.047 0.2900 −0.043 0.3410 −0.058 0.21 0.24 0.071
STAT1 0.44 *** 0.472 *** 0.3 *** 0.12 0.36
IFN-γ(IFNG) 0.311 *** 0.337 *** 0.19 0.000026*** 0.075 0.57
TNF-α(TNF) 0.103 0.0194* 0.124 0.0056** 0.055 0.23 0.33 0.011*
Th2 GATA3 0.174 0.0001*** 0.204 *** 0.19 0.000026*** 0.03 0.82
CCR3 −0.02 0.6430 0.001 0.9890 −0.015 0.74 0.11 0.41
STAT6 −0.07 0.1120 −0.077 0.0858 −0.028 0.55 0.27 0.042*
STAT5A 0.055 0.2140 0.076 0.0925 −0.0088 0.85 0.44 0.00056**
Th9 TGFBR2 −0.13 0.0032** −0.123 0.0064*** −0.12 0.0077*** −0.19 0.14
IRF4 0.062 0.1620 0.077 0.0858 −0.068 0.13 0.44 0.00053**
PU.1(SPI1) −0.039 0.3770 −0.038 0.4040 −0.11 0.015* 0.24 0.071
Th17 STAT3 0.023 0.5980 0.021 0.6350 0.021 0.64 0.12 0.38
IL-21R 0.149 0.0007*** 0.188 *** 0.037 0.41 0.26 0.05
IL-23R 0.002 0.9580 0.006 0.9010 −0.033 0.47 0.11 0.39
IL-17A 0.089 0.0436* 0.089 0.0494 0.073 0.11 0.17 0.19
Th22 CCR10 0.094 0.0321* 0.08 0.0774 0.11 0.013* −0.086 0.52
AHR −0.014 0.7550 −0.014 0.7500 −0.012 0.79 0.003 0.98
Treg FOXP3 0.157 0.0004*** 0.183 *** 0.04 0.38 0.42 0.001**
CD25(IL2RA) 0.24 *** 0.271 *** 0.15 0.00068 0.11 0.39
CCR8 0.183 *** 0.214 *** 0.064 0.16 0.21 0.11
T cell exhaustion PD-1(PDCD1) 0.219 *** 0.259 *** 0.083 0.068 0.38 0.0029**
CTLA4 0.24 *** 0.29 *** 0.14 0.0029 0.27 0.04
LAG3 0.265 *** 0.286 *** 0.12 0.0086 0.43 0.00071***
TIM-3(HAVCR2) 0.074 0.0951 0.088 0.0516 −0.033 0.46 0.097 0.46
Macrophage CD68 0.034 0.4350 0.044 0.3340 −0.032 0.49 0.15 0.26
CD11b (ITGAM) 0.006 0.9000 0.019 0.6670 −0.026 0.57 0.23 0.074
M1 INOS(NOS2) 0.042 0.3420 0.029 0.5260 0.048 0.29 −0.25 0.058
IRF5 0.125 0.0045** 0.134 0.0028 0.087 0.057 0.4 0.0016**
COX2(PTGS2) 0.016 0.7150 0 0.9920 0.02 0.66 −0.048 0.72
M2 CD16 0.042 0.3440 0.055 0.2230 −0.0086 0.85 0.065 0.62
ARG1 −0.001 0.9830 −0.011 0.8150 0.059 0.19 −0.038 0.77
MRC1 −0.083 0.0588 −0.079 0.0786 −0.075 0.1 0.38 0.0031**
MS4A4A −0.001 0.9860 0.007 0.8760 −0.083 0.069 0.25 0.06
TAM CCL2 0.074 0.0921 0.081 0.0739 0.0014 0.97 −0.015 0.91
CD80 0.129 0.0033** 0.153 0.0006 0.079 0.082 0.15 0.25
CD86 0.078 0.0755 0.095 0.0355 −0.028 0.54 0.22 0.1
CCR5 0.14 0.0014 0.177 0.0001 0.056 0.22 0.27 0.04*
Monocyte CD14 0.041 0.3530 0.058 0.1960 −0.06 0.19 −0.12 0.35
CD16(FCGR3B) 0.042 0.3440 0.055 0.2230 −.0086 0.85 0.065 0.62
CD115(CSF1R) 0.011 0.8050 0.026 0.5690 −0.047 0.3 0.34 0.00088**
Neutrophil CD66b (CEACAM8) −0.23 *** −0.229 *** −0.1 0.025 −0.013 0.92
CD15(FUT4) 0.058 0.1890 0.047 0.2940 0.15 0.0013 0.15 0.26
CD11b (ITGAM) 0.006 0.9000 0.019 0.6670 −0.026 0.57 0.23 0.074
Natural killer cell XCL1 0.225 *** 0.261 *** 0.2 0.0000058 −0.17 0.19
CD7 0.191 *** 0.219 *** 0.063 0.17 0.16 0.22
KIR3DL1 0.035 0.4270 0.042 0.3560 0.00052 0.99 −0.19 0.16
Dendritic cell CD1C(BDCA-1) −0.339 *** −0.344 *** −0.23 0.00000028 0.11 0.43
CD141 (THBD) −0.183 *** −0.188 *** −0.075 0.1 −0.12 0.38
CD11c 0.133 0.0026** 0.154 0.0006 0.011 0.81 0.35 0.0071**

correlation without adjustment, Purity: correlation adjusted by purity, Cor, correlation coefficient. *p < 0.05, **p < 0.01, and ***p < 0.001.