. 2022 May 11;13:825685. doi: 10.3389/fgene.2022.825685

TABLE 2.

Correlation between FANCD2 levels and markers of immune cells based on TIMER and GEPIA databases.

Cell type	Gene marker	None		Purity		Tumor		Normal
Cell type	Gene marker	Cor	P	Cor	P	R	P	R	P
B cell	CD19	−0.003	0.9410	0.004	0.9210	−0.085	0.063	0.41	0.0011^**
	CD20(KRT20)	0.027	0.5440	0.021	0.6440	0.071	0.12	−0.039	0.77
	CD38	0.049	0.2720	0.064	0.1560	−0.0043	0.92	0.14	0.29
CD8⁺ T cell	CD8A	0.201	^***	0.231	^***	0.078	0.085	0.11	0.41
	CD8B	0.192	^***	0.202	^***	0.12	0.0082^**	0.085	0.52
	BCL6	0.019	0.6600	0.024	0.5960	0.056	0.22	0.13	0.31
	ICOS	0.162	0.0002^***	0.202	^***	0.069	0.13	0.32	0.014^**
	CXCR5	−0.013	0.7760	−0.005	0.9150	−0.098	0.032	0.4	0.0017^**
Th1	T-bet (TBX21)	0.156	0.0004^***	0.184	^***	0.035	0.44	−0.033	0.8
	STAT4	0.081	0.0646	0.098	0.0291	0.033	0.47	0.31	0.18
	IL12RB2	0.457	^***	0.483	^***	0.22	^***	0.14	0.29
	WSX1(IL27RA)	−0.047	0.2900	−0.043	0.3410	−0.058	0.21	0.24	0.071
	STAT1	0.44	^***	0.472	^***	0.3	^***	0.12	0.36
	IFN-γ(IFNG)	0.311	^***	0.337	^***	0.19	0.000026^***	0.075	0.57
	TNF-α(TNF)	0.103	0.0194^*	0.124	0.0056^**	0.055	0.23	0.33	0.011^*
Th2	GATA3	0.174	0.0001^***	0.204	^***	0.19	0.000026^***	0.03	0.82
	CCR3	−0.02	0.6430	0.001	0.9890	−0.015	0.74	0.11	0.41
	STAT6	−0.07	0.1120	−0.077	0.0858	−0.028	0.55	0.27	0.042^*
	STAT5A	0.055	0.2140	0.076	0.0925	−0.0088	0.85	0.44	0.00056^**
Th9	TGFBR2	−0.13	0.0032^**	−0.123	0.0064^***	−0.12	0.0077^***	−0.19	0.14
	IRF4	0.062	0.1620	0.077	0.0858	−0.068	0.13	0.44	0.00053^**
	PU.1(SPI1)	−0.039	0.3770	−0.038	0.4040	−0.11	0.015^*	0.24	0.071
Th17	STAT3	0.023	0.5980	0.021	0.6350	0.021	0.64	0.12	0.38
	IL-21R	0.149	0.0007^***	0.188	^***	0.037	0.41	0.26	0.05
	IL-23R	0.002	0.9580	0.006	0.9010	−0.033	0.47	0.11	0.39
	IL-17A	0.089	0.0436^*	0.089	0.0494	0.073	0.11	0.17	0.19
Th22	CCR10	0.094	0.0321^*	0.08	0.0774	0.11	0.013^*	−0.086	0.52
Th22	AHR	−0.014	0.7550	−0.014	0.7500	−0.012	0.79	0.003	0.98
Treg	FOXP3	0.157	0.0004^***	0.183	***	0.04	0.38	0.42	0.001^**
	CD25(IL2RA)	0.24	^***	0.271	***	0.15	0.00068	0.11	0.39
	CCR8	0.183	^***	0.214	***	0.064	0.16	0.21	0.11
T cell exhaustion	PD-1(PDCD1)	0.219	^***	0.259	***	0.083	0.068	0.38	0.0029^**
	CTLA4	0.24	^***	0.29	***	0.14	0.0029	0.27	0.04
	LAG3	0.265	^***	0.286	***	0.12	0.0086	0.43	0.00071^***
	TIM-3(HAVCR2)	0.074	0.0951	0.088	0.0516	−0.033	0.46	0.097	0.46
Macrophage	CD68	0.034	0.4350	0.044	0.3340	−0.032	0.49	0.15	0.26
Macrophage	CD11b (ITGAM)	0.006	0.9000	0.019	0.6670	−0.026	0.57	0.23	0.074
M1	INOS(NOS2)	0.042	0.3420	0.029	0.5260	0.048	0.29	−0.25	0.058
	IRF5	0.125	0.0045^**	0.134	0.0028	0.087	0.057	0.4	0.0016^**
	COX2(PTGS2)	0.016	0.7150	0	0.9920	0.02	0.66	−0.048	0.72
M2	CD16	0.042	0.3440	0.055	0.2230	−0.0086	0.85	0.065	0.62
	ARG1	−0.001	0.9830	−0.011	0.8150	0.059	0.19	−0.038	0.77
	MRC1	−0.083	0.0588	−0.079	0.0786	−0.075	0.1	0.38	0.0031^**
	MS4A4A	−0.001	0.9860	0.007	0.8760	−0.083	0.069	0.25	0.06
TAM	CCL2	0.074	0.0921	0.081	0.0739	0.0014	0.97	−0.015	0.91
	CD80	0.129	0.0033^**	0.153	0.0006	0.079	0.082	0.15	0.25
	CD86	0.078	0.0755	0.095	0.0355	−0.028	0.54	0.22	0.1
	CCR5	0.14	0.0014	0.177	0.0001	0.056	0.22	0.27	0.04^*
Monocyte	CD14	0.041	0.3530	0.058	0.1960	−0.06	0.19	−0.12	0.35
	CD16(FCGR3B)	0.042	0.3440	0.055	0.2230	−.0086	0.85	0.065	0.62
	CD115(CSF1R)	0.011	0.8050	0.026	0.5690	−0.047	0.3	0.34	0.00088^**
Neutrophil	CD66b (CEACAM8)	−0.23	^***	−0.229	***	−0.1	0.025	−0.013	0.92
	CD15(FUT4)	0.058	0.1890	0.047	0.2940	0.15	0.0013	0.15	0.26
	CD11b (ITGAM)	0.006	0.9000	0.019	0.6670	−0.026	0.57	0.23	0.074
Natural killer cell	XCL1	0.225	^***	0.261	***	0.2	0.0000058	−0.17	0.19
	CD7	0.191	^***	0.219	***	0.063	0.17	0.16	0.22
	KIR3DL1	0.035	0.4270	0.042	0.3560	0.00052	0.99	−0.19	0.16
Dendritic cell	CD1C(BDCA-1)	−0.339	^***	−0.344	***	−0.23	0.00000028	0.11	0.43
	CD141 (THBD)	−0.183	^***	−0.188	***	−0.075	0.1	−0.12	0.38
	CD11c	0.133	0.0026^**	0.154	0.0006	0.011	0.81	0.35	0.0071^**

correlation without adjustment, Purity: correlation adjusted by purity, Cor, correlation coefficient. *p < 0.05, **p < 0.01, and ***p < 0.001.