Skip to main content
. 2022 May 11;14:849462. doi: 10.3389/fnagi.2022.849462

TABLE 2.

List of 14 patients carrying rare P/LP variants in PD associated genes.

No. Sample ID Gender OA Gene Nucleotide change A.A. alteration Exonic Func. Hom/Het Mode of Inheritance ACMG Reported
1 4309 M 23 PRKN c.850G > C p.G284R non-syn Hom AR LP Y
2 4328 M 19 PRKN c.850G > C p.G284R non-syn Hom AR LP Y
PRKN Exon5-7 del CNV Het AR P Y
3 4349 M 26 PRKN Exon2-3 del CNV Het AR P Y
PRKN Exon5 del CNV Het AR P Y
4 4351 M 48 PRKN Exon2-3 dup CNV Het AR P Y
PRKN Exon4 dup CNV Het AR P Y
5 4354 F 28 PRKN c.1079G > T p.C360F non-syn Het AR LP Y
PRKN Exon3-5 del CNV Het AR P Y
6 4364 M 28 PRKN c.850G > C p.G284R non-syn Het AR LP Y
PRKN Exon3-4 del CNV Het AR P Y
7 4427 M 37 PRKN Exon6 del CNV Het AR P Y
PRKN Exon3-4 del CNV Het AR P Y
8 4355 M 33 PLA2G6 c.1634A > G p.K545R non-syn Het AR LP Y
PLA2G6 c.991G > T p.D331Y non-syn Het AR LP Y
9 4390 M 48 LRRK2 c.6055G > A p.G2019S non-syn Het AD LP Y
10 4339 M 30 LRRK2 c.4339G > A p.V1447M non-syn Het AD LP Y
11 4292 F 50 CHCHD2 c.297C > A p.Y99X stopgain Het AD P N
12 4356 M 35 DNAJC13 c.2578C > T p.R860C non-syn Het AD LP N
13 4375 F 50 SNCA c.14T > C p.M5T non-syn Het AD LP N
14 4392 M 50 TMEM230 c.4C > T p.Q2X stopgain Het AD P N

OA: onset age; ACMG: American College of Medical Genetics and Genomics; P: pathogenic; LP: likely pathogenic; non-syn: non-synonymous mutation; CNV: Copy number variants; Hom: Homozygous; Het: Heterozygous.

Patient 3 and patient 10 have an ARPD family history; other 12 patients were sporadic.