Skip to main content
. 2022 May 25;11(11):1557. doi: 10.3390/foods11111557

Table 1.

Target bacterial strains used for inclusivity of the developed mPCR assay.

Number of Strains Target Bacterial Strains
55 Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC a) DMST b 48719; STEC DMST 50662; STEC PSU c 5023; STEC DMST 19341; STEC DMST 50661; STEC PSU 38; STEC PSU 5030; STEC DMST 50660; STEC PSU 4189; STEC PSU 4159; STEC DMST 30538; STEC DMST 30536; STEC DMST 30537; STEC PSU 149; STEC PSU 150; STEC DMST 19340; STEC DMST 19342; STEC DMST 30539; STEC DMST 50659; STEC PSU 133; STEC PSU 135; STEC PSU 148; STEC PSU 4153; STEC PSU 4154; STEC PSU 4155; STEC PSU 4156; STEC PSU 4157; STEC PSU 4158; STEC PSU 4160; STEC PSU 4161; STEC PSU 4162; STEC PSU 4163; STEC PSU 4164; STEC PSU 4165; STEC PSU 4166; STEC PSU 4167; STEC PSU 4169; STEC PSU 4170; STEC PSU 4171; STEC PSU 4172; STEC PSU 4173; STEC PSU 4191; STEC PSU 4192; STEC PSU 4193; STEC PSU 4196; STEC PSU 4197; STEC PSU 5026; STEC PSU 5027; STEC PSU 5028; STEC PSU 5029; STEC PSU 3802; STEC PSU 4190; STEC PSU 4195; STEC PSU 4198 and STEC CDC d 03-3014
50 L. monocytogenes ATCC e 7644; L. monocytogenes Li 23 ATCC 19114 L. monocytogenes Li 2107 ATCC 19116; L. monocytogenes DMST 41455; L. monocytogenes DMST 17303; L. monocytogenes DMST 20093; L. monocytogenes DMST 20422; L. monocytogenes DMST 20423; L. monocytogenes DMST 20425; L. monocytogenes DMST 21164; L. monocytogenes DMST 21165; L. monocytogenes DMST 23136; L. monocytogenes DMST 23146; L. monocytogenes DMST 23150; L. monocytogenes DMST 23151; L. monocytogenes DMST 23710; L. monocytogenes DMST 27738; L. monocytogenes DMST 31799; L. monocytogenes DMST 31800; L. monocytogenes DMST 31801; L. monocytogenes DMST 31802; L. monocytogenes DMST 31804; L. monocytogenes DMST 32862; L. monocytogenes DMST 33253; L. monocytogenes DMST 36156; L. monocytogenes DMST 37884; L. monocytogenes DMST 37885; L. monocytogenes DMST 41456; L. monocytogenes DMST 41457; L. monocytogenes DMST 41458; L. monocytogenes DMST 41642; L. monocytogenes DMST 41647; L. monocytogenes DMST 44932; L. monocytogenes DMST 44933; L. monocytogenes DMST 44934; L. monocytogenes DMST 44935; L. monocytogenes DMST 44936; L. monocytogenes DMST 45433; L. monocytogenes DMST 45683; L. monocytogenes DMST 45984; L. monocytogenes DMST 46456; L. monocytogenes DMST 47501; L. monocytogenes DMST 47502; L. monocytogenes DMST 47503; L. monocytogenes DMST 50339; L. monocytogenes 100; L. monocytogenes 101; L. monocytogenes 108; L. monocytogenes 310 and L. monocytogenes Scott A
102 S. Aberdeen DMST 19198; S. Abony PVKU 1 f; S. Agona DMST 23970; S. Alachua DMST 19203; S. Albany DMST 50696; S. Altona DMST 62226; S. Amsterdam WPKU 1 g; S. Anatum DMST 50705; S. Apeyeme PVKU 2; S. Augustenborg DMST 50631; S. Bangkok DMST 50834; S. Bareilly DMST 62231; S. Bergen DMST 19206; S. Blockley DMST 16821; S. Bongori ATCC 43975; S. Bovismorbificans DMST 17379; S. Braenderup DMST 62234; S. Bredeney PVKU 3; S. Canstatt PVKU 4; S. Cerro DMST 19200; S. Chester WPKU 2; S. Chicago KU 1 h; S. Corvalis KU 2; S. Derby DMST 16880; S. Dublin WPKU 3; S. Eastbourne WPKU 4; S. Emek WPKU 5; S. enterica subsp. Salamae ser, 17:gt: DMST 19207; S. Adelaide ATCC 10718; S. Bispebjerg ATCC 9842; S. Choleraesuis ATCC 6958; S. Gaminara ATCC 8324; S. Heerlen ATCC 15792; S. Hillingdon ATCC 9184; S. Illinois ATCC 11646; S. Inverness ATCC 10720; S. Kirkee ATCC 8322; S. Oranienburg ATCC 9239; S. Pullorum ATCC 9120; S. Simsbury ATCC 12004; S. Vellore ATCC 15611; S. Zwickau ATCC 15805; S. Dar-es-salaam ATCC 6959; S. Hooggraven ATCC 15786; S. Enteritidis DMST 15676; S. Falkensee DMST 50716; S. Fresno DMST 19197; S. Give DMST 50827; S. Hadar DMST 32769; S. Havana DMST 50710; S. Heidelberg PVKU 5; S. Hvittingfoss DMST 62220; S. Indiana PVKU 6; S. Infatis PVKU 7; S. I4,12:i:- PVKU 8; S. Johnnesburg DMST 50835; S. Kedougou DMST 33890; S. Kentucky DMST 50701; S. KiamBu PVKU 9; S. Krefeld DMST 62227; S. Lexington DMST 50707; S. Liverpool PVKU 10; S. Livingstone DMST 50633; S. London DMST 62232; S. Manhattan PVKU 11; S. Matopeni DMST 62218; S. Mbandaka DMST 62238; S. Minnesota KU 3; S. Molade PVKU 12; S. Montevideo PVKU 13; S. Moscow PVKU 14; S. Muenchen PVKU 15; S. Muenster DMST 62235; S. Newport DMST 15675; S. Orion WPKU 6; S. Oslo WPKU 7; S. Ouakam DMST 50824; S. Panama DMST 50703; S. Paratyphi A DMST 15673; S. Paratyphi B WPKU 8; S. Paratyphi C WPKU 9; S. Poona KU 4; S. Ramat-gan WPKU 10; S. Rissen DMST 16876; S. Rubislaw DMST 62223; S. Saintpaul DMST 62225; S. Schwarzengrund WPKU 11; S. Typhi WPKU 12; S. Singapore DMST 50636; S. Stanley DMST 33894; S. Tennessee WPKU 13; S. Thempson PVKU 16; S. Typhimurium DMST 562; S. Brunei KU 5; S. Virchow DMST 16857; S. Wandsworth DMST 19204; S. Warthington DMST 33889; S. Waycross DMST 19205; S. Weltevreden DMST 16820; S. Urbana PVKU 17; S. Soerenga PVKU 18 and S. Weston PVKU 19

a STEC = Shiga toxin-producing Escherichia coli; b DMST = Department of Medical Science, Ministry of Public Health, Bangkok, Thailand; c PSU = Department of Microbiology, Faculty of Science, Prince of Songkla University, Songkla, Thailand; d CDC = Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, GA, USA; e ATCC = The American Type Culture Collection, Manassas, VA, USA; f PVKU = Collection cultures in our laboratory, Kasetsart University, Bangkok, Thailand; g WPKU = Collection cultures in our laboratory, Kasetsart University, Bangkok, Thailand; h KU = Collection cultures in our laboratory, Kasetsart University, Bangkok, Thailand.