TABLE 1.
Tannase and gallate decarboxylase activities, carbohydrate utilization profiles, and identities of Lactobacillus isolates
| Strain | Source | Tannase | Gallate decarboxylase | Carbohydrate utilization profile as determined with the API 50 CHL system
|
|||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Glycerol | Erythritol | d-Arabinose | l-Arabinose | Ribose | d-Xylose | l-Xylose | Adonitol | β-Methyl-xyloside | Galactose | d-Glucose | d-Fructose | d-Mannose | l-Sorbose | Rhamnose | Dulcitol | Inositol | Mannitol | Sorbitol | α-Methyl-d-mannoside | α-Methyl-d-glucoside | N-Acetylglucosamine | ||||
| KLH 1 | Human feces | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | + | − | + |
| KLH 2 | Human feces | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | + | − | − | + | + | + | − | + |
| KLH 3 | Human feces | + | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | − | + |
| KOG 1 | Pickled rice bran | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | + | + |
| KOG 2 | Turnip pickled with rice bran | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | − | + |
| KOG 3 | Korean cabbage kimchi | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | − | + |
| KOG 4 | Cucumber pickled with rice bran | + | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | + | − | + | + | − | − | + |
| KOG 5 | Chinese pickled with rice bran | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | + |
| KOG 6 | Radish pickled with rice bran | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | + | + |
| KOG 7 | Pickled eggplant and cucumber | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | + | + |
| KOG 8 | Korean cabbage kimchi | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | − | + |
| KOG 9 | Chinese cabbage pickled with rice bran | + | + | + | − | − | + | + | + | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | + | + |
| KOG 10 | Eggplant pickled with rice bran | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | + | − | + |
| KOG 11 | Chinese cabbage pickled with rice bran | + | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | + | + |
| KOG 12 | Pickled radish and tang | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | + | − | + |
| KOG 13 | Korean radish kimchi | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | + |
| KOG 14 | Pickled eggplant | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | + | + |
| KOG 15 | Korean cabbage kimchi | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | + | + |
| KOG 16 | Korean cabbage kimchi | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | − | + |
| KOG 17 | Pickled vegetables | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | + | + |
| KOG 18 | Turnip pickled with rice bran | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | + | − | + |
| KOG 19 | Mixed vegetables pickled with rice bran | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | + | − | + |
| KOG 20 | Pickled cucumber and radish | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | + | + |
| KOG 21 | Pickled vegetables | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | + | − | + |
| KOG 22 | Chinese cabbage pickled with rice bran | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | − | + |
| KOG 23 | Korean radish kimchi | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | + | − | + |
| KOG 24 | Cheese | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | − | + |
| KOG 25 | Korean cabbage kimchi | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | + |
| Carbohydrate utilization profile as determined with the API 50 CHL system
|
Putative taxon by the API 50 CHL systema | Taxon as determined by PCR assayb | ||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Amygdalin | Arbutin | Esculin | Salicin | Cellobiose | Maltose | Lactose | Melibiose | Sucrose | Trehalose | Inulin | Melezitose | d-Raffinose | Starch | Glycogen | Xylitol | β-Gentiobiose | d-Turanose | d-Lyxose | d-Tagatose | d-Fucose | l-Fucose | d-Arabitol | l-Arabitol | Gluconate | 2-Keto-gluconate | 5-Keto-gluconate | ||
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | + | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | L. plantarum | L. paraplantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | L. plantarum | L. paraplantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | L. pentosus | L. pentosus |
| + | + | + | + | + | + | − | − | + | + | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | + | − | + | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − | + | − | + | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | L. plantarum | L. paraplantarum |
| + | + | + | + | + | + | − | − | + | + | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | Undetermined | L. paraplantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | L. pentosus | L. pentosus |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | − | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | L. plantarum | L. paraplantarum |
| + | + | + | + | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | L. plantarum | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | Undetermined | L. plantarum |
| + | + | + | + | + | + | − | + | + | + | − | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | Undetermined | L. paraplantarum |
a
With the API analytical profile indices (>99.0% identity) expressed as “good identification” or “excellent identification.”
b
Described by Berthier and Ehrlich (2).