TABLE 2.
Detection of enteric viruses in the five shellfish-sampling points during the 3-year study
| Date | Presence of virusa
|
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Site A
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Site B
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Site C
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Site D
|
Site E
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| EV | HAV | NLV | AV | RV | FCsb | EV | HAV | NLV | AV | RV | FCs | EV | HAV | NLV | AV | RV | FCs | EV | HAV | NLV | AV | RV | FCs | EV | HAV | NLV | AV | RV | FCs | |
| 1995 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Aug | ND | ND | <30 | + | 140 | + | + | ND | ||||||||||||||||||||||
| Sep | + | 500 | 57 | <30 | + | ND | + | + | + | + | + | 3,400 | ||||||||||||||||||
| Oct | + | <30 | <30 | <30 | + | 78 | + | + | 300 | |||||||||||||||||||||
| Nov | + | 30 | + | 60 | + | <30 | + | + | + | 832 | + | + | ND | |||||||||||||||||
| Dec | + | + | + | 640 | + | <30 | 159 | + | + | + | + | + | 1,789 | + | + | + | + | ND | ||||||||||||
| 1996 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Jan | + | + | + | 2,970 | + | + | + | 300 | + | 51 | + | + | + | + | 2,600 | + | + | + | + | 3,380 | ||||||||||
| Feb | + | + | 213 | + | + | + | <30 | + | <30 | 733 | + | + | + | ND | ||||||||||||||||
| Mar | + | + | ND | + | + | + | ND | + | + | <30 | 7,800 | + | + | + | + | ND | ||||||||||||||
| Apr | ND | ND | <30 | + | + | + | <30 | + | + | 243 | ||||||||||||||||||||
| May | <30 | <30 | + | + | 2,970 | NS | NS | NS | NS | NS | NS | + | + | 128 | ||||||||||||||||
| Jun | <30 | + | 45 | <30 | + | + | + | 1,390 | + | + | <30 | |||||||||||||||||||
| Jul | + | + | ND | ND | 139 | 128 | ND | |||||||||||||||||||||||
| Aug | + | <30 | + | 49 | + | <30 | + | + | <30 | + | + | + | + | 128 | ||||||||||||||||
| Sep | ND | + | ND | + | 143 | <30 | + | + | ND | |||||||||||||||||||||
| Oct | <30 | ND | + | ND | + | + | + | 80 | + | + | 404 | |||||||||||||||||||
| Nov | + | + | 108 | + | 47 | + | <30 | + | + | + | + | 2,020 | + | + | + | + | 46 | |||||||||||||
| Dec | + | + | + | + | <30 | + | + | + | + | 341 | + | + | + | + | <30 | + | + | + | + | + | 875 | + | + | + | + | 760 | ||||
| 1997 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Jan | + | + | + | + | 937 | + | + | + | + | 31 | + | + | + | + | <30 | + | + | + | + | + | 1,100 | + | + | + | + | ND | ||||
| Feb | <30 | <30 | + | <30 | + | + | + | + | + | 48 | + | 520 | ||||||||||||||||||
| Mar | <30 | <30 | <30 | + | + | + | <30 | + | + | + | <30 | |||||||||||||||||||
| Apr | <30 | 232 | + | <30 | <30 | + | + | <30 | ||||||||||||||||||||||
| May | 2,970 | 130 | <30 | 139 | + | + | 645 | |||||||||||||||||||||||
| Jun | + | 95 | + | <30 | <30 | + | 500 | <30 | ||||||||||||||||||||||
| Jul | 53 | + | <30 | + | 115 | <30 | 3,870 | |||||||||||||||||||||||
| Aug | <30 | + | <30 | NS | NS | NS | NS | NS | NS | 387 | + | 83 | ||||||||||||||||||
| Sep | + | <30 | + | <30 | + | <30 | 1,200 | + | 341 | |||||||||||||||||||||
| Oct | + | 36 | + | <30 | + | <30 | 44 | + | + | 264 | ||||||||||||||||||||
| Nov | + | <30 | NS | NS | NS | NS | NS | NS | <30 | 44 | + | + | 3,350 | |||||||||||||||||
| Dec | + | <30 | NS | NS | NS | NS | NS | NS | + | <30 | + | + | + | 233 | + | + | + | 265 | ||||||||||||
| 1998 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Jan | + | + | 41 | + | 139 | + | <30 | + | + | 2,280 | + | + | 937 | |||||||||||||||||
| Feb | 47 | + | <30 | <30 | + | + | 568 | + | 387 | |||||||||||||||||||||
| Mar | + | 197 | <11 | + | <11 | + | + | ND | + | + | + | + | ND | |||||||||||||||||
| Apr | + | <30 | <30 | 3,380 | + | + | 265 | + | + | + | + | 341 | ||||||||||||||||||
| May | 5,670 | <30 | 300 | 261 | 3,380 | |||||||||||||||||||||||||
| Jun | + | <30 | <30 | <30 | + | 205 | + | <30 | ||||||||||||||||||||||
| Jul | <30 | 69 | <30 | 265 | 122 | |||||||||||||||||||||||||
| Aug | + | 53 | <30 | <30 | 568 | 53 | ||||||||||||||||||||||||
+, sample found positive by RT-PCR and hybridization for EV, HAV, NLV, AV, or RV.
FC concentration (most probable number/100 g of shellfish) detected in the shellfish sample. Underlined numbers indicate the presence of Salmonella; ND, not done; boldface numbers, above the acceptable European bacterial standard (forbidden for human consumption); all others are in accordance with the European bacterial standard for human consumption; NS, no sample.