Supplementary Table S9.
Comparison of Immune Profiles from Flow Cytometry and Cibersort among Different Psoriasis Subgroups
| Data Source | Immune Population | AVG ± SD |
Significance (Wilcox Test) |
||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Healthy | PSO1 | PSO2 | PSO3 | Healthy Versus PSO1 | Healthy Versus PSO2 | Healthy Versus PSO3 | PSO1 Versus PSO2 | PSO1 Versus PSO3 | PSO2 Versus PSO3 | ||
| Immunephenotype | Teff (CD3+ CD4+ CD25‒ FoxP3‒) | 80.49 ± 5.98% | 83.33 ± 3.15% | 83.49 ± 3.71% | 80.8 ± 3.29% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. |
| Active Teff (CD3+ CD4+ CD25+ FoxP3‒ CD38+ HLADR+) | 0.13 ± 0.09% | 0.27 ± 0.26% | 0.09 ± 0.03% | 0.36 ± 0.25% | n.s. | n.s. | 0.035 | n.s. | n.s. | 0.024 | |
| Memory Teff (CD3+ CD4+ CD25‒ FoxP3‒ CD45RO+) | 33.72 ± 10.14% | 34.55 ± 13.64% | 35.81 ± 12.12% | 36.3 ± 10.2% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| Active memory Teff (CD3+ CD4+ CD25‒ FoxP3‒ CD45RO+ CD38+ HLADR+) | 0.31 ± 0.34% | 0.55 ± 0.55% | 0.18 ± 0.08% | 0.67 ± 0.56% | n.s. | n.s. | n.s. | 0.018 | n.s. | 0.02 | |
| Tregs (CD3+ CD4+ CD25+ FoxP3+) | 6.46 ± 2.66% | 5.81 ± 1.03% | 6.13 ± 1.22% | 6.53 ± 1.26% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| Activated Tregs (CD3+ CD4+ CD25+ FoxP3+, CD45RO+) | 70.65 ± 11.6% | 67.99 ± 9.84% | 66.94 ± 10.33% | 69.95 ± 6.3% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| Cytokine production | Teff (CD3+ CD4+ CD127+) | 58.51 ± 15.43% | 52.79 ± 18.71% | 58.85 ± 10.83% | 39.48 ± 18.33% | n.s. | n.s. | 0.02 | n.s. | n.s. | 0.04 |
| Teff IL17+ only | 0.93 ± 0.87% | 1.1 ± 1.56% | 0.78 ± 0.53% | 1.11 ± 0.5% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| Teff IL22+ only | 0.66 ± 0.51% | 0.68 ± 0.39% | 1.75 ± 2% | 0.89 ± 0.58% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| Teff IL17+ IL22+ | 0.13 ± 0.15% | 0.15 ± 0.16% | 0.32 ± 0.41% | 0.15 ± 0.06% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| Teff TNF-α+ only | 0.69 ± 0.77% | 0.84 ± 0.87% | 1.28 ± 1.37% | 0.6 ± 0.21% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| Teff IFNγ+ only | 10.73 ± 3.92% | 11 ± 4.07% | 12.02 ± 7.43% | 11.81 ± 4.17% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| Teff TNF-α+ IFNγ+ | 0.63 ± 0.71% | 0.44 ± 0.3% | 1 ± 1.64% | 0.44 ± 0.23% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| CIBERSORTx | Th1 | 0.02 ± 0.02% | 0.01 ± 0.01% | 0.03 ± 0.02% | 0.02 ± 0.02% | n.s. | n.s. | n.s. | 0.012 | n.s. | n.s. |
| Th17 | 0.08 ± 0.02% | 0.08 ± 0.02% | 0.09 ± 0.02% | 0.09 ± 0.03% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| Treg | 0.05 ± 0% | 0.05 ± 0% | 0.05 ± 0.01% | 0.06 ± 0.01% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | 0.02 | |
| Tcm | 0.02 ± 0% | 0.02 ± 0% | 0.02 ± 0% | 0.02 ± 0% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| Tfh | 0.01 ± 0% | 0.01 ± 0% | 0.01 ± 0% | 0.01 ± 0% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| Activated CD4 T | 0.14 ± 0.03% | 0.14 ± 0.02% | 0.14 ± 0.02% | 0.11 ± 0.01% | n.s. | n.s. | 0.014 | n.s. | 0.024 | 0.02 | |
| Immunephenotype | CD8(CD3+ CD8+) | 30.19 ± 10.33% | 32.09 ± 12.33% | 24.66 ± 9.14% | 31 ± 12.52% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. |
| Active CD8 (CD3+ CD8+ CD38+ HLADR+) | 0.52 ± 0.28% | 1.3 ± 1.65% | 0.44 ± 0.25% | 1.09 ± 0.81% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| Memory CD8 (CD3+ CD8+ CD45RO+) | 15.36 ± 6.22% | 15.57 ± 8.13% | 25.34 ± 6.52% | 16.45 ± 6.41% | n.s. | 0.002 | n.s. | 0.02 | n.s. | 0.029 | |
| Activated memory CD8 (CD3+ CD8+ CD45RO+ CD38+ HLADR+) | 2.04 ± 1.61% | 3.5 ± 4.8% | 1.18 ± 1.01% | 3.09 ± 1.81% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | 0.04 | |
| Cytokine production | CD8 (CD3+ CD8+) | 27.21 ± 10.1% | 30.32 ± 12.55% | 23.69 ± 9.09% | 27.08 ± 13.52% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. |
| CD8+ IL17+ only | 0.12 ± 0.08% | 0.15 ± 0.08% | 0.28 ± 0.36% | 0.17 ± 0.08% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| CD8+ IL22+ only | 0.14 ± 0.19% | 0.07 ± 0.06% | 0.47 ± 0.64% | 0.08 ± 0.04% | n.s. | n.s. | n.s. | 0.023 | n.s. | n.s. | |
| CD8+ IL17+ IL22+ | 0.02 ± 0.01% | 0.02 ± 0.01% | 0.15 ± 0.2% | 0.02 ± 0.03% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| CD8+ TNF-α+ only | 0.04 ± 0.07% | 0.09 ± 0.22% | 0.14 ± 0.18% | 0.06 ± 0.06% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| CD8+ IFNγ+ only | 16.47 ± 7.85% | 16.09 ± 9.52% | 20.17 ± 12.71% | 20.45 ± 8.55% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| CD8+ TNF-α+ IFNγ+ | 0.4 ± 0.29% | 0.35 ± 0.35% | 0.46 ± 0.65% | 0.66 ± 0.58% | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | n.s. | |
| CIBERSORTx | CD8 T | 0.00375 ± 0.0065% | 0.00326 ± 0.00408% | 0.00053 ± 0.00133% | 0.01483 ± 0.01089% | n.s. | n.s. | 0.026 | 0.043 | 0.042 | 0.011 |
Abbreviations: AVG, average; n.s., not significant; Tcm, T central memory; Teff, effector T cell; tfh, T follicular helper; Th, T helper; Treg, regulatory T cell.