Table 1.
Contingency table comparing epidemiological clustering (A–H) vs. WGS clustering (I–XI) as the reference method.
| WGS clustering | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| I | II | III | IV | V | VI | VII | VIII | IX | X | XI | S | Total | ||
| Epidemiological clustering | A | 2 | 2 | 4 | ||||||||||
| B | 2 | 2 | ||||||||||||
| C | 3 | 3 | ||||||||||||
| D | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 9 | ||||||||
| E | 1 | 3 | 4 | 8 | ||||||||||
| F | 2 | 1 | 1 | 4 | ||||||||||
| G | 1 | 4 | 1 | 6 | ||||||||||
| H | 2 | 1 | 1 | 4 | ||||||||||
| S | 4 | 2 | 2 | 1 | 2 | 12 | 23 | |||||||
| Total | 16 | 4 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 4 | 3 | 21 | 63 | |
S, Singleton.