TABLE 3.

Evolutionary distances among small-subunit rRNAs of various representatives of the CFB phylum

Organism	Evolutionary distance
	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25
1. Escherichia coli
2. Endosymbiont	0.2059
3. b-17BO	0.3093	0.3202
4. b-10RA	0.3193	0.3316	0.0129
5. b-1BO	0.3171	0.3218	0.0129	0.0243
6. b-1BO University of Turin	0.3375	0.3565	0.0309	0.0293	0.0427
7. b-Z43	0.3209	0.3357	0.0169	0.0121	0.0285	0.0210
8. Strain PB90-2	0.2937	0.3246	0.1813	0.1895	0.1854	0.2043	0.1918
9. Strain XB45	0.2925	0.3209	0.1803	0.1885	0.1844	0.2032	0.1907	0.0080
10. Flavobacterium	0.3315	0.3165	0.1979	0.2042	0.1979	0.2237	0.2065	0.1656	0.1646
11. Cytophaga strain BD-2	0.2949	0.3183	0.1752	0.1834	0.1752	0.2022	0.1876	0.1062	0.1062	0.1900
12. Cytophaga strain Sva 1039	0.2949	0.3218	0.1771	0.1832	0.1781	0.2020	0.1875	0.1145	0.1164	0.1921	0.1099
13. Uncultured strain WCHB1-53	0.2892	0.3149	0.1866	0.1949	0.1887	0.2119	0.1971	0.1165	0.1165	0.1850	0.1119	0.1372
14. Uncultured strain WCHB1-69	0.2892	0.3237	0.1764	0.1845	0.1796	0.2024	0.1868	0.1403	0.1384	0.2061	0.1308	0.1509	0.1203
15. Clone SB5	0.2879	0.3149	0.1639	0.1719	0.1649	0.1916	0.1762	0.0977	0.0958	0.1777	0.0895	0.1218	0.1210	0.1354
16. Sphingobacterium sp.	0.3007	0.3118	0.1734	0.1795	0.1716	0.1981	0.1817	0.1772	0.1783	0.2042	0.1732	0.1864	0.1815	0.1744	0.1852
17. Sphingobacterium heparinum	0.2995	0.3155	0.1664	0.1734	0.1666	0.1919	0.1756	0.1844	0.1854	0.2116	0.1803	0.1926	0.1784	0.1754	0.1862	0.0285
18. Sphingobacterium spiritivorum	0.3113	0.3201	0.1736	0.1838	0.1789	0.2028	0.1840	0.1826	0.1805	0.2375	0.1795	0.1826	0.1880	0.1766	0.1814	0.1000	0.1093
19. Flexibacter canadensis	0.2991	0.3100	0.1605	0.1696	0.1596	0.1883	0.1718	0.1796	0.1817	0.2126	0.1632	0.1755	0.1829	0.1593	0.1681	0.1025	0.1015	0.1087
20. Sphingobacterium mizutaü	0.3063	0.3268	0.1675	0.1768	0.1770	0.1970	0.1770	0.1687	0.1749	0.2310	0.1770	0.1864	0.1823	0.1688	0.1800	0.1018	0.1018	0.0672	0.1200
21. Bacteroides fragilis	0.3307	0.3512	0.2134	0.2231	0.2136	0.2396	0.2233	0.1749	0.1759	0.2372	0.1789	0.1933	0.1740	0.1924	0.1809	0.2166	0.1966	0.2315	0.2069	0.2248
22. CFB group strain DF-3	0.3381	0.3444	0.2158	0.2276	0.2181	0.2454	0.2289	0.1720	0.1700	0.2093	0.1730	0.1832	0.1834	0.1823	0.1708	0.2147	0.2073	0.2164	0.1932	0.2110	0.1403
23. Cytophaga flevensis	0.3199	0.3138	0.2008	0.2072	0.2019	0.2260	0.2085	0.1579	0.1589	0.0411	0.1855	0.1762	0.1774	0.1901	0.1793	0.2040	0.2170	0.2246	0.2038	0.2212	0.2253	0.2038
24. Flavobacterium aquatile	0.3236	0.3232	0.2139	0.2204	0.2139	0.2382	0.2227	0.1585	0.1555	0.0537	0.1838	0.1777	0.1748	0.1998	0.1664	0.1969	0.2107	0.2311	0.2182	0.2228	0.2419	0.2178	0.0561
25. Flavobacterium balustinum	0.3313	0.3167	0.2177	0.2266	0.2167	0.2460	0.2290	0.1818	0.1818	0.1659	0.1902	0.1966	0.1758	0.1864	0.1822	0.2036	0.2211	0.2126	0.2087	0.2162	0.2544	0.2248	0.1646	0.1553
26. Flavobacterium ferrugineum	0.3119	0.3194	0.2175	0.2262	0.2199	0.2386	0.2275	0.2262	0.2262	0.2275	0.2132	0.2208	0.2342	0.2254	0.2429	0.2351	0.2328	0.2664	0.2281	0.2668	0.2516	0.2644	0.2239	0.2387	0.2438

^aAll positions used to calculate the distances meet the condition that a known nucleotide is present in all of the sequences analyzed (51). The alignment used was based on sequences from position 177 to position 1457 (E. coli numbering).