. 2001 Aug;67(8):3501–3513. doi: 10.1128/AEM.67.8.3501-3513.2001

TABLE 3.

Variable amino acids in predicted open reading frames of either genomic or cDNA copies of Sig1 amplified from T. weissflogii clone Actin

Template	Clone	Amino acids at the following positions^a:
Template	Clone	9	10	22	43	52	60	63	66	67	68	95	100	119	131	137	138	139	144	148	159	168	169	171	177	181	182	185	186
Genomic	Reference	R	N	P	D	S	T	F	M	S	D	G	L	S	N	F	N	A	H	E	H	L	A	L	Y	D	K	T	M
	1	.	.	.	.	.	.	L	.	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
	2	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	.	.	S
	3	.	.	.	.	P	.	L	.	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	D	R	.	.	.	.	.	.	.	.
	4	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
	5	.	.	.	.	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	.	.
	6	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
	7	G	.	.	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
	8	.	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
	9	.	.	.	.	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	.	.
	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
cDNA	1	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
	2	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	.	.	.	.	.	.	.
	3	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	P	.
	4	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
	5	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
	6	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.
	7	.	.	.	.	.	.	.	V	.	.	.	.	.	H	.	.	.	.	.	.	.	.	S	.	.	.	.	.
	8	.	.	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	H	.	.	.	.
	9	.	.	.	.	.	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
	10	.	.	.	.	.	.	.	.	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
	11	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.
	12	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
	13	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.

The positions are numbered relative to the first predicted amino acid of the open reading frame. Roman type indicates conservative changes, italic type indicates moderate changes, and underlining indicates radical changes. A dot indicates that the amino acid is identical to the amino acid in the reference clone.