Skip to main content
. 2022 Jun 30;14(7):1458. doi: 10.3390/v14071458

Table 3.

The main amino acid residues that interact with fisetin and myricetin in the catalytic pocket of SARS-CoV-2 nsp14 ExoN in the presence of one or two Mg(II) ions.

Compound Amino Acid Residue Interaction Distance (Å)
Fisetin
(1 × Mg(II))
Met-58 Van der Waals 3.40
Glu-92 Van der Waals 3.10
Asn-104 Hydrogen bonding 2.80
Phe-146 Van der Waals 3.80
Ala-187 Van der Waals 2.00
Phe-190 Van der Waals 3.40
Glu-191 Hydrogen bonding 2.10
Myricetin
(1 × Mg(II))
Met-58 Van der Waals 2.30
Asp-90 Van der Waals 3.80
Val-91 (C=O) Hydrogen bonding 1.70
Glu-92 Van der Waals 2.80
Asn-104 Hydrogen bonding 3.30
Phe-146 Van der Waals 3.40
Ala-187 Van der Waals 2.20
Phe-190 Van der Waals 3.80
Glu-191 Hydrogen bonding 2.10
Fisetin
(2 × Mg(II))
Met-58 Van der Waals 2.30
Asp-90 Van der Waals 3.70
Glu-92 Van der Waals 2.40
His-95 Van der Waals 2.90
Asn-104 Van der Waals 2.80
Ala-187 Van der Waals 3.40
Gly-189 Van der Waals 2.80
Glu-191 Hydrogen bonding 2.20
Myricetin
(2 × Mg(II))
Met-58 Van der Waals 2.60
Asp-90 Van der Waals 3.80
Val-91 (C=O) Hydrogen bonding 1.70
Glu-92 Van der Waals 3.00
His-95 Van der Waals 2.80
Asn-104 Hydrogen bonding 2.20
Ala-187 Van der Waals 2.40
Gly-189 Van der Waals 3.00
Phe-190 Van der Waals 3.70
Glu-191 Hydrogen bonding 2.90